254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2098 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  100 
 
 
278 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  93.17 
 
 
307 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  93.17 
 
 
307 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  93.53 
 
 
278 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  93.53 
 
 
278 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  93.53 
 
 
278 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  92.86 
 
 
280 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  92.86 
 
 
280 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  78.06 
 
 
300 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  77.7 
 
 
303 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  78.42 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  78.42 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  78.78 
 
 
277 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  78.78 
 
 
303 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  78.42 
 
 
352 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  70.04 
 
 
302 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  70.44 
 
 
284 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  71.9 
 
 
292 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  47.25 
 
 
277 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  46.89 
 
 
277 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  43.17 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  46.72 
 
 
290 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  43.07 
 
 
279 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  42.49 
 
 
280 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  43.53 
 
 
278 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  42.18 
 
 
293 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  43.07 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  43.07 
 
 
279 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  41.61 
 
 
279 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  45.62 
 
 
286 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  44.32 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  44.84 
 
 
287 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  40.22 
 
 
280 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  40.96 
 
 
277 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  45.99 
 
 
276 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  41.7 
 
 
302 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  40.73 
 
 
280 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  38.83 
 
 
278 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  41.43 
 
 
281 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  38.35 
 
 
293 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  38.13 
 
 
286 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  36.82 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  39.58 
 
 
284 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  28.67 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  30 
 
 
293 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 
332 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  30.74 
 
 
310 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.39 
 
 
289 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  30.04 
 
 
298 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  27.17 
 
 
325 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.97 
 
 
312 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.01 
 
 
324 aa  99  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  25.45 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  26.22 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  29.82 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  27.64 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  31.96 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  27.53 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  32.23 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.53 
 
 
310 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  27.08 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  27.05 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  28.06 
 
 
308 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  28.83 
 
 
339 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.5 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.82 
 
 
311 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  31.37 
 
 
310 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  32.66 
 
 
294 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  25.37 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  28.52 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  23.51 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  25.83 
 
 
311 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  25 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  23.51 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  25.2 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28 
 
 
337 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 
294 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  27.4 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1548  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 
293 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  23.13 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  29.3 
 
 
317 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  23.81 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  24.53 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  24.1 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  23.02 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  24.64 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  29.35 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.28 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  29.75 
 
 
310 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0577  squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  28.64 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  28.32 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  28.24 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  25.09 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  31.84 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  27.82 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  26.02 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  28.28 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>