More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1647 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2561  murein transglycosylase domain-containing protein  89.84 
 
 
431 aa  733    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0417  murein transglycosylase domain-containing protein  89.71 
 
 
474 aa  807    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2983  murein transglycosylase domain-containing protein  87.17 
 
 
458 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1647  murein transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  921    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0212  murein transglycosylase domain-containing protein  89.43 
 
 
433 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0937  murein transglycosylase domain-containing protein  87.99 
 
 
431 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2936  lytic murein transglycosylase B  88.11 
 
 
452 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2873  lytic murein transglycosylase B  87.99 
 
 
431 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0861868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2248  lytic murein transglycosylase B  72.56 
 
 
444 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0932  lytic murein transglycosylase B  72.77 
 
 
448 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1015  lytic murein transglycosylase B  76.87 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0577  lytic murein transglycosylase B  77.06 
 
 
405 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4169  lytic murein transglycosylase B  76.81 
 
 
405 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.743519  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0936  lytic murein transglycosylase B  76.6 
 
 
406 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0991  putative murein transglycosylase  76.84 
 
 
409 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2992  lytic murein transglycosylase B  75.26 
 
 
392 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106271  hitchhiker  0.00132596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0755  lytic murein transglycosylase B  71.78 
 
 
462 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1056  lytic murein transglycosylase B  81.39 
 
 
321 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2556  lytic murein transglycosylase B  61.05 
 
 
368 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0732  lytic murein transglycosylase B  62.27 
 
 
408 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351039  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0918  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  61.89 
 
 
372 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.841841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0788  lytic murein transglycosylase B  56.32 
 
 
374 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.297958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0859  lytic murein transglycosylase B  60.37 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2520  lytic murein transglycosylase B  44.86 
 
 
347 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160631  normal  0.119321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3012  lytic murein transglycosylase B  44.16 
 
 
354 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3149  lytic murein transglycosylase B  40.65 
 
 
366 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1216  lytic murein transglycosylase B  42.37 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1242  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  39.13 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00209703  normal  0.108974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3380  lytic murein transglycosylase B  41.71 
 
 
363 aa  246  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0518683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4968  lytic murein transglycosylase B  42.06 
 
 
336 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.763775  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2160  lytic murein transglycosylase B  40.8 
 
 
361 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203112  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4363  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.43 
 
 
335 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116504  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2545  lytic murein transglycosylase B  40.88 
 
 
356 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12080  soluble lytic transglycosylase B  42.14 
 
 
340 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0509  lytic murein transglycosylase B  35.77 
 
 
422 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2099  lytic murein transglycosylase B  41.69 
 
 
365 aa  236  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342273  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2817  lytic murein transglycosylase B  40.51 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.280732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08410  lytic murein transglycosylase B  41.82 
 
 
342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.562186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2306  lytic murein transglycosylase B  40.51 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4823  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.81 
 
 
335 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4858  lytic murein transglycosylase B  41.32 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1108  soluble lytic transglycosylase B  41.82 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4805  lytic murein transglycosylase B  41.01 
 
 
348 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785804  normal  0.425937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4680  lytic murein transglycosylase B  41.56 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0616  lytic murein transglycosylase B  41.4 
 
 
336 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573967  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3796  lytic murein transglycosylase B  42.77 
 
 
336 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2383  lytic murein transglycosylase B  42.12 
 
 
392 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455496  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1294  lytic murein transglycosylase B  40 
 
 
417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00378747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0724  lytic murein transglycosylase B  41.29 
 
 
362 aa  224  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5017  murein hydrolase B  41.33 
 
 
371 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3399  murein hydrolase B  42.24 
 
 
361 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2114  murein hydrolase B  39.07 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2634  lytic murein transglycosylase B  41.38 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3339  Zn-finger, DksA/TraR C4 type  38.64 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917071  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0697  lytic murein transglycosylase B  39.81 
 
 
337 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0681454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57730  murein hydrolase B  42.25 
 
 
367 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2951  murein hydrolase B  39.63 
 
 
359 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3140  murein hydrolase B  39.63 
 
 
359 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3033  murein hydrolase B  39.63 
 
 
359 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.986861  hitchhiker  0.00384978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3017  murein hydrolase B  39.63 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  hitchhiker  0.00000130232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0993  lytic murein transglycosylase B  36.17 
 
 
354 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000510709  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2708  murein hydrolase B  40.16 
 
 
364 aa  217  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102119  hitchhiker  0.00940641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0174  lytic murein transglycosylase B  41.9 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.35243  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0977  murein hydrolase B  43.44 
 
 
361 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1351  murein hydrolase B  40.16 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.720495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1464  murein hydrolase B  40.7 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2982  murein hydrolase B  42.5 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000956693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1166  membrane-bound lytic transglycosylase, putative  35.73 
 
 
354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1054  lytic murein transglycosylase B  35.73 
 
 
354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000218585  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2077  lytic murein transglycosylase B  36.24 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0554951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3151  lytic murein transglycosylase B  38.94 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000109427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0988  lytic murein transglycosylase B  40.31 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3176  murein hydrolase B  40.31 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2985  murein hydrolase B  40.31 
 
 
361 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.26128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3333  murein hydrolase B  42.81 
 
 
356 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2837  murein hydrolase B  40.31 
 
 
361 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1011  murein hydrolase B  40.31 
 
 
361 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000289241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2590  lytic murein transglycosylase B  40.97 
 
 
329 aa  212  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164218  normal  0.320646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02551  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.31 
 
 
361 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02516  hypothetical protein  40.31 
 
 
361 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.360268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3948  murein hydrolase B  40.31 
 
 
361 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315849  normal  0.782651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1835  hypothetical protein  38.37 
 
 
338 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2824  murein hydrolase B  40 
 
 
361 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0997605  hitchhiker  0.00000822387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0989  lytic murein transglycosylase B  35.47 
 
 
354 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000275469  normal  0.0108965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1838  hypothetical protein  38.07 
 
 
338 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0853  lytic murein transglycosylase B  42.8 
 
 
336 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114292  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3237  murein hydrolase B  40.12 
 
 
383 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3319  lytic murein transglycosylase B  36.93 
 
 
356 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000245768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3277  lytic murein transglycosylase B  35.6 
 
 
356 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000759763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3330  murein hydrolase B  40.12 
 
 
381 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1090  lytic murein transglycosylase B  35.6 
 
 
356 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257265  hitchhiker  0.00000204091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2709  lytic murein transglycosylase B  40.67 
 
 
344 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3455  lytic murein transglycosylase B  35.33 
 
 
356 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000138517  normal  0.0101722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3710  lytic murein transglycosylase B  42.29 
 
 
337 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000626578  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2871  lytic murein transglycosylase B  40.67 
 
 
354 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000283207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1269  lytic murein transglycosylase B  40.88 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3487  lytic murein transglycosylase B  42.19 
 
 
339 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  hitchhiker  0.0000000197037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1972  lytic murein transglycosylase B  39.49 
 
 
341 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1010  lytic murein transglycosylase B  40.13 
 
 
327 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2937  lytic murein transglycosylase B  35.8 
 
 
335 aa  189  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000220956  normal  0.0240906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>