More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1443 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 
920 aa  1907    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0930  UvrD/REP helicase  38.13 
 
 
932 aa  635  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0490168  normal  0.240502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  32.69 
 
 
921 aa  423  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_256  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
972 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 
984 aa  312  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 
970 aa  310  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1482  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 
911 aa  290  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0495505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 
946 aa  265  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 
946 aa  265  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  28.28 
 
 
727 aa  204  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  27.7 
 
 
727 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  27.55 
 
 
727 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  27.65 
 
 
729 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  28.14 
 
 
728 aa  197  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  28.24 
 
 
728 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  25.13 
 
 
966 aa  195  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  26.97 
 
 
728 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 
682 aa  194  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  26.83 
 
 
728 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  26.83 
 
 
728 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  26.74 
 
 
727 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  26.33 
 
 
723 aa  190  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  28.99 
 
 
724 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 
785 aa  189  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 
735 aa  189  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.93 
 
 
671 aa  188  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  27.96 
 
 
720 aa  187  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.65 
 
 
725 aa  187  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 
685 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 
845 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  27.33 
 
 
720 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  27.33 
 
 
720 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  25.8 
 
 
689 aa  186  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  27.33 
 
 
720 aa  185  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  185  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  186  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  186  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  185  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 
754 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.41 
 
 
737 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  27.3 
 
 
753 aa  184  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.25 
 
 
689 aa  184  9.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
671 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.17 
 
 
729 aa  183  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 
671 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  27.72 
 
 
727 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  27.58 
 
 
726 aa  182  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 
688 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  27.11 
 
 
724 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 
783 aa  182  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  26.2 
 
 
773 aa  181  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  29.94 
 
 
725 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  27.17 
 
 
722 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.79 
 
 
797 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  25.89 
 
 
734 aa  181  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 
722 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 
722 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  27.86 
 
 
722 aa  180  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 
722 aa  181  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  27.79 
 
 
720 aa  180  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  27.61 
 
 
722 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  27.86 
 
 
722 aa  180  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  27.86 
 
 
722 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  27.79 
 
 
720 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  27.66 
 
 
722 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 
741 aa  179  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  27.79 
 
 
720 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  27.79 
 
 
720 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  27.79 
 
 
720 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  27.79 
 
 
720 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 
720 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 
730 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 
730 aa  179  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 
787 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  27.92 
 
 
720 aa  179  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  27.46 
 
 
722 aa  178  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 
714 aa  178  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  26.29 
 
 
726 aa  178  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.16 
 
 
721 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  25.89 
 
 
717 aa  177  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 
737 aa  177  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.55 
 
 
713 aa  177  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  27.32 
 
 
724 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.22 
 
 
751 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 
724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.42 
 
 
739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  26.84 
 
 
723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 
757 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.83 
 
 
732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.77 
 
 
726 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.43 
 
 
759 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 
659 aa  173  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 
797 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  27.33 
 
 
720 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 
797 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  26.07 
 
 
724 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  25.26 
 
 
749 aa  173  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 
705 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>