More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1367 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  100 
 
 
377 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  38.07 
 
 
393 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  37.2 
 
 
403 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  34.42 
 
 
401 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  36 
 
 
393 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  33.24 
 
 
407 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  32.61 
 
 
395 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  34.75 
 
 
399 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  34.13 
 
 
388 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  35.34 
 
 
395 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  37.27 
 
 
391 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  33.95 
 
 
430 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  30.71 
 
 
391 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  34.31 
 
 
394 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  32.69 
 
 
393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.44 
 
 
403 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  35.58 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  31.52 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  29.74 
 
 
413 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  25.4 
 
 
495 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  28.31 
 
 
415 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.51 
 
 
406 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  28.61 
 
 
415 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  27.6 
 
 
496 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  27.78 
 
 
408 aa  96.3  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.68 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.9 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26.62 
 
 
394 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.73 
 
 
404 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.23 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  26.95 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2218  aminotransferase class V  32.99 
 
 
426 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245886  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.16 
 
 
408 aa  87.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  27.85 
 
 
393 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  28.64 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.04 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  23.95 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  27.85 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.38 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.39 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.05 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  29.95 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  27.4 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.64 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.95 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  27.14 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.06 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.76 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.47 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  28.24 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.86 
 
 
678 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  24.05 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  20.53 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1497  Cysteine desulfurase  25.91 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.43 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  21.57 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  27.8 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  27.91 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.24 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.01 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  28.25 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  27.8 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.22 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  25.45 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  34.24 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  22.8 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.33 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  27.8 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.33 
 
 
896 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.83 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.49 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.54 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  28.28 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.86 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  23.48 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  28.27 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  24.94 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  22.8 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.55 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  22.8 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.25 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.6 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  27.8 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  27.8 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  27.8 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.33 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  25.89 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  22.19 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.02 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.55 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  26.67 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  27.35 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  26.67 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  27.35 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  27.13 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2511  aminotransferase, class V  25.45 
 
 
389 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  25.16 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.19 
 
 
416 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>