59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1267 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  507  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  82.06 
 
 
256 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  82.06 
 
 
256 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  82.06 
 
 
256 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  82.1 
 
 
252 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  82.1 
 
 
252 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  81.71 
 
 
252 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  81.97 
 
 
239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  71.29 
 
 
240 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  63.39 
 
 
239 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  72.11 
 
 
240 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  72.11 
 
 
238 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  70.53 
 
 
242 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  71.05 
 
 
238 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  73.75 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  60.4 
 
 
248 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  57.64 
 
 
250 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  59 
 
 
233 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  58.79 
 
 
233 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  42.24 
 
 
253 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  45.45 
 
 
233 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  46.41 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  36.46 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  38.38 
 
 
192 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  33 
 
 
207 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  32.8 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  35.79 
 
 
210 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  36.91 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  35.32 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  31.84 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  31.9 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  31.98 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  30.73 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  32.82 
 
 
201 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  34.66 
 
 
195 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  35 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  34.38 
 
 
196 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  27.18 
 
 
212 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  33.14 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  31.84 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  31.05 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  28.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  29.48 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.27 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.9 
 
 
191 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  30.99 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  28.5 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  31.03 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  28.27 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  32.14 
 
 
206 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.83 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  28.79 
 
 
212 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  30.43 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  25.65 
 
 
198 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.34 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  34.29 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  27.52 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>