More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1037 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  99.16 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  99.16 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  94.26 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  95.73 
 
 		 252 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  95.3 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  94.87 
 
 		 252 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  95.3 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  94.87 
 
 		 252 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  94.87 
 
 		 252 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  83.26 
 
 		 241 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  82.85 
 
 		 241 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  82.77 
 
 		 238 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  65.45 
 
 		 231 aa  318  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  66.82 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 235 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  66.82 
 
 		 236 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  36.61 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  35.84 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  38.27 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  31.73 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  30.05 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 204 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 204 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  28.42 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.76 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.7 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>