More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0884 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  97.51 
 
 		 363 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  97.51 
 
 		 362 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  97.51 
 
 		 362 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  97.51 
 
 		 362 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  97.51 
 
 		 362 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  97.51 
 
 		 362 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  100 
 
 		 362 aa  727    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  97.51 
 
 		 362 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  80.52 
 
 		 360 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  79.37 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  78.8 
 
 		 360 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  79.08 
 
 		 359 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  79.08 
 
 		 359 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  79.08 
 
 		 359 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  78.8 
 
 		 358 aa  517  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  69.71 
 
 		 375 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  69.92 
 
 		 369 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  71.02 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  71.54 
 
 		 383 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  66.32 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  48.37 
 
 		 370 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  47.31 
 
 		 371 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  46.77 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  46.77 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  46.77 
 
 		 371 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  46.51 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  46.51 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  46.51 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  46.51 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  48.17 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  48.02 
 
 		 367 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  47.89 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  47.89 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  46.72 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  47.32 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  47.32 
 
 		 369 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  47.19 
 
 		 369 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  43.49 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  42.47 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  42.53 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  40.69 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  39.24 
 
 		 353 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  40.46 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  42.21 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  37.2 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  36.11 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  38.36 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  39.89 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  37.5 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  32.6 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.51 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.79 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.89 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.81 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.83 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.99 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  34.07 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  34.35 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  34.9 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  32.64 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.86 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.64 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  33.7 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.7 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  33.7 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.62 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  32.96 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  32.96 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.78 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  33 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  34.6 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  31.52 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  31.65 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  31.55 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.53 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.3 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  34.51 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.36 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.36 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.36 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.36 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.36 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.36 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.02 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.97 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  32.09 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  32.67 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  31.32 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  31.83 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.61 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  31.59 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.25 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.34 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  33.15 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  30 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.16 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  37.23 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>