169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0807 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  100 
 
 		 181 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  76.8 
 
 		 444 aa  297  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  66.85 
 
 		 400 aa  255  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  66.3 
 
 		 400 aa  253  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  66.85 
 
 		 401 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  65.75 
 
 		 399 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  65.19 
 
 		 400 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  66.85 
 
 		 401 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  66.85 
 
 		 399 aa  251  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  64.64 
 
 		 400 aa  249  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  64.64 
 
 		 400 aa  249  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  70.17 
 
 		 399 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  70.17 
 
 		 399 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  65.75 
 
 		 401 aa  248  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  69.61 
 
 		 415 aa  246  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  69.61 
 
 		 415 aa  246  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  64.09 
 
 		 399 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  62.98 
 
 		 467 aa  237  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  65.19 
 
 		 412 aa  225  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  72.5 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  41.81 
 
 		 411 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  42.37 
 
 		 384 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  42.37 
 
 		 384 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  41.81 
 
 		 397 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  37.29 
 
 		 393 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  35.52 
 
 		 388 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  39.75 
 
 		 452 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  36.65 
 
 		 451 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  37.27 
 
 		 452 aa  97.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  36.65 
 
 		 451 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  33.54 
 
 		 451 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  34.38 
 
 		 429 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  34.27 
 
 		 434 aa  91.3  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  36.42 
 
 		 432 aa  87.8  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  34.55 
 
 		 463 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  34.64 
 
 		 426 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  32.02 
 
 		 387 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 379 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  36.14 
 
 		 422 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.79 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  29.44 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.49 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  41.12 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 402 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 449 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.42 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  32.58 
 
 		 424 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  29.31 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  27.47 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  27.47 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  31.22 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.86 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.71 
 
 		 448 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  34.11 
 
 		 420 aa  57.8  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  28.25 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  27.22 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  36.14 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.14 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.77 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  27.17 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.57 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 443 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.81 
 
 		 410 aa  55.1  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.07 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.52 
 
 		 417 aa  55.1  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 432 aa  54.7  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.45 
 
 		 439 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25 
 
 		 389 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  27.17 
 
 		 439 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.25 
 
 		 433 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  24.21 
 
 		 401 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  29.17 
 
 		 430 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 411 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.81 
 
 		 417 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  23.47 
 
 		 444 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.6 
 
 		 417 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  26.63 
 
 		 419 aa  51.2  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.75 
 
 		 401 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 420 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.28 
 
 		 421 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.2 
 
 		 402 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 389 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  24.83 
 
 		 397 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  30.22 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.21 
 
 		 406 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.15 
 
 		 414 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  26 
 
 		 398 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.15 
 
 		 414 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  25.15 
 
 		 443 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.23 
 
 		 400 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  30.77 
 
 		 400 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  25.93 
 
 		 643 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>