More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0754 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  99.6 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  91.94 
 
 
258 aa  470  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  91.94 
 
 
258 aa  470  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  91.53 
 
 
248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  91.13 
 
 
248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  91.13 
 
 
248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  91.13 
 
 
248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  91.13 
 
 
248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  85.89 
 
 
248 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  85.08 
 
 
248 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  84.68 
 
 
248 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  71.49 
 
 
244 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  71.07 
 
 
244 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  71.49 
 
 
244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
244 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  65.84 
 
 
244 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  65.84 
 
 
244 aa  338  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  66.26 
 
 
244 aa  338  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  65.43 
 
 
244 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  65.43 
 
 
244 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  65.4 
 
 
247 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
244 aa  314  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  62.08 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
244 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  64.98 
 
 
277 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  62.08 
 
 
244 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  62.03 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  54.27 
 
 
240 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
240 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  47.21 
 
 
241 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
249 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  45.73 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.3 
 
 
255 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  46.52 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
256 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
254 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  42.36 
 
 
250 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  41.92 
 
 
254 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
286 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  41.48 
 
 
254 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
257 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
257 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
264 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
265 aa  158  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
265 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
249 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
257 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
241 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
241 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
255 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  39.57 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.89 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 
248 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 
248 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
248 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
248 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
248 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
247 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  37.61 
 
 
243 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
255 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
248 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
243 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
248 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
243 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
243 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
243 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
243 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 
247 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 
245 aa  121  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
232 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
244 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>