More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0550 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  97.32 
 
 
1342 aa  2664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  92.34 
 
 
1344 aa  2525    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  70.72 
 
 
1292 aa  1921    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  68.7 
 
 
1308 aa  1821    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  80.3 
 
 
1345 aa  2209    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  97.47 
 
 
1342 aa  2667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.35 
 
 
1282 aa  1365    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  70.57 
 
 
1279 aa  1937    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  80.59 
 
 
1345 aa  2217    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.01 
 
 
1279 aa  1954    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.61 
 
 
1307 aa  1833    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  97.39 
 
 
1342 aa  2664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  71.48 
 
 
1308 aa  1905    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  88.05 
 
 
1364 aa  2486    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 
1221 aa  773    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  67.47 
 
 
1291 aa  1792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  81.46 
 
 
1324 aa  2257    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  66.16 
 
 
1259 aa  1729    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  65.89 
 
 
1292 aa  1736    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  97.47 
 
 
1342 aa  2667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.74 
 
 
1265 aa  1853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  97.39 
 
 
1342 aa  2664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.25 
 
 
1304 aa  1882    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  91.65 
 
 
1341 aa  2524    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.09 
 
 
1214 aa  762    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  37.08 
 
 
1202 aa  772    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.88 
 
 
1341 aa  2519    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  58.23 
 
 
1280 aa  1543    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.21 
 
 
1292 aa  1804    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.5 
 
 
1304 aa  1872    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  67.69 
 
 
1307 aa  1834    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.88 
 
 
1341 aa  2519    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  55.89 
 
 
1277 aa  1414    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 
1359 aa  2810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  97.39 
 
 
1342 aa  2664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.87 
 
 
1309 aa  1920    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  36.65 
 
 
1213 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  91.95 
 
 
1340 aa  2513    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.13 
 
 
1210 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  68.79 
 
 
1307 aa  1873    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  65.06 
 
 
1271 aa  1745    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  69.98 
 
 
1300 aa  1912    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.26 
 
 
1218 aa  772    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  36.55 
 
 
1218 aa  744    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  88.14 
 
 
1349 aa  2463    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.45 
 
 
1286 aa  1442    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  81.46 
 
 
1324 aa  2262    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  59 
 
 
1289 aa  1520    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 
1212 aa  726    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  80.59 
 
 
1345 aa  2216    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  91.88 
 
 
1341 aa  2519    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  89.53 
 
 
1371 aa  2486    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  35.59 
 
 
1212 aa  726    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.02 
 
 
1288 aa  1504    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  97.39 
 
 
1342 aa  2664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  92.25 
 
 
1340 aa  2518    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  55.89 
 
 
1277 aa  1414    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 
1183 aa  515  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  30.69 
 
 
1197 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 
1183 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.06 
 
 
1227 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  35.38 
 
 
1217 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  29.33 
 
 
1188 aa  258  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 
1187 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  31.99 
 
 
1204 aa  254  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  27.07 
 
 
472 aa  107  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  27.07 
 
 
472 aa  106  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.57 
 
 
459 aa  105  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  26.12 
 
 
457 aa  102  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.53 
 
 
459 aa  102  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  25.96 
 
 
473 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.56 
 
 
460 aa  99.8  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.51 
 
 
472 aa  98.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.45 
 
 
460 aa  98.2  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.86 
 
 
460 aa  97.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 
473 aa  97.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.86 
 
 
460 aa  97.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  26.14 
 
 
473 aa  97.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
475 aa  97.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  26.2 
 
 
473 aa  97.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.68 
 
 
493 aa  96.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.75 
 
 
469 aa  96.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.62 
 
 
411 aa  95.9  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  21.95 
 
 
430 aa  95.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.24 
 
 
473 aa  95.1  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  24.09 
 
 
456 aa  95.1  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.57 
 
 
461 aa  94.7  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.35 
 
 
418 aa  94.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.94 
 
 
475 aa  94.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.81 
 
 
434 aa  94.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.66 
 
 
473 aa  94.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.9 
 
 
473 aa  94.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.23 
 
 
461 aa  93.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  25.11 
 
 
711 aa  93.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  25.94 
 
 
524 aa  92.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  25.94 
 
 
473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  25.94 
 
 
473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  25.94 
 
 
473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  25.94 
 
 
473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  25.94 
 
 
473 aa  92.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>