179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0534 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  97.44 
 
 
312 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  98.51 
 
 
269 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  98.14 
 
 
269 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  98.51 
 
 
269 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  98.51 
 
 
269 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  98.51 
 
 
269 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  98.51 
 
 
269 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  70.34 
 
 
260 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.92 
 
 
260 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
260 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.07 
 
 
260 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.49 
 
 
260 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.49 
 
 
260 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.49 
 
 
260 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.51 
 
 
244 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.94 
 
 
244 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.94 
 
 
244 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.14 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.14 
 
 
267 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
240 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  51.43 
 
 
242 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
238 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
239 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
239 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.33 
 
 
238 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.1 
 
 
254 aa  235  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.85 
 
 
239 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
243 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
243 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
243 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
239 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
239 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.17 
 
 
239 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
239 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
239 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.09 
 
 
240 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
239 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.88 
 
 
247 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
250 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
239 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
244 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.58 
 
 
239 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.44 
 
 
239 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
232 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
246 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.93 
 
 
232 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  48.23 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.49 
 
 
232 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  44.8 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.12 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
245 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.31 
 
 
243 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  45.75 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.58 
 
 
239 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.81 
 
 
236 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 
244 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.05 
 
 
263 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  46.05 
 
 
258 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  46.89 
 
 
274 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  41.2 
 
 
246 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.2 
 
 
246 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
340 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
242 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.75 
 
 
255 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  42.15 
 
 
242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.26 
 
 
279 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.38 
 
 
245 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.17 
 
 
260 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  37.98 
 
 
260 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  37.98 
 
 
260 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  37.98 
 
 
260 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  42.92 
 
 
234 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
255 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
262 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  40.91 
 
 
259 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
260 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
260 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
248 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  38.5 
 
 
238 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  36.73 
 
 
252 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
258 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.94 
 
 
338 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.58 
 
 
247 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3374  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.66 
 
 
256 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  37 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
231 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  35.78 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35.81 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
236 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>