More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0499 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  98.48 
 
 
395 aa  759    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  91.95 
 
 
385 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  98.44 
 
 
385 aa  738    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  98.44 
 
 
385 aa  738    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  88.84 
 
 
490 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  89.62 
 
 
395 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  91.65 
 
 
395 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  100 
 
 
478 aa  940    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  91.9 
 
 
395 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  98.48 
 
 
395 aa  759    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  92.15 
 
 
395 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  93.16 
 
 
395 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  98.44 
 
 
385 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  91.9 
 
 
395 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  98.44 
 
 
385 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  92.47 
 
 
385 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  86.23 
 
 
385 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  86.84 
 
 
395 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  86.75 
 
 
385 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  67.28 
 
 
387 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  65.46 
 
 
394 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  65.71 
 
 
387 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  54.34 
 
 
407 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  51.46 
 
 
418 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  53.89 
 
 
416 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  47.24 
 
 
458 aa  359  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  50.66 
 
 
416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  49.61 
 
 
461 aa  354  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  50.9 
 
 
453 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
401 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4567  major facilitator transporter  50.51 
 
 
424 aa  330  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1609  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 
394 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1904  major facilitator transporter  48.96 
 
 
394 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  44.36 
 
 
465 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  46.17 
 
 
464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  45.15 
 
 
464 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  44.42 
 
 
462 aa  318  9e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  47.04 
 
 
454 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  43.51 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  42.86 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  46.41 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  47.72 
 
 
458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  42.86 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  42.86 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  43.51 
 
 
454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  43.51 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  43.51 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  42.86 
 
 
453 aa  312  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
455 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
454 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
454 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  48.48 
 
 
462 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  43.26 
 
 
454 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  47.14 
 
 
429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  42.09 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  42.09 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  46.45 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  41.94 
 
 
454 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  46.19 
 
 
464 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
457 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  49.49 
 
 
400 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4065  major facilitator superfamily transporter  50.39 
 
 
393 aa  300  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  43.04 
 
 
455 aa  299  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  46.68 
 
 
464 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  45.82 
 
 
462 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0295  major facilitator superfamily transporter  48.57 
 
 
396 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  45.69 
 
 
464 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  45.69 
 
 
464 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  43.59 
 
 
458 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  46.27 
 
 
454 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  43.33 
 
 
458 aa  293  7e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  42.78 
 
 
454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  44.69 
 
 
471 aa  289  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  45.9 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  42.2 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  42.75 
 
 
455 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  40.05 
 
 
455 aa  279  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  39.52 
 
 
455 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4711  major facilitator superfamily transporter  49.25 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0955  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.903849  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0813  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  42.01 
 
 
454 aa  273  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  41.03 
 
 
455 aa  272  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  41.94 
 
 
455 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  41.86 
 
 
455 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  41.34 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  41.34 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  42.89 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  42.38 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  41.34 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  40.83 
 
 
455 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  41.79 
 
 
455 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>