275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0423 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  100 
 
 
255 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  90.59 
 
 
255 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  90.59 
 
 
255 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  90.59 
 
 
255 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  90.59 
 
 
255 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  90.59 
 
 
255 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  90.59 
 
 
255 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  92.53 
 
 
242 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  70.64 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  69.36 
 
 
261 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  69.43 
 
 
268 aa  298  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  70.31 
 
 
257 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  62.74 
 
 
270 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  62.74 
 
 
270 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6179  phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
263 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2861  phosphoribosyltransferase  63.32 
 
 
265 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.603337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2236  phosphoribosyltransferase  62.31 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2850  phosphoribosyltransferase  63.08 
 
 
265 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  48.25 
 
 
240 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  47.35 
 
 
240 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  47.14 
 
 
222 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  45.93 
 
 
279 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
239 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  48.15 
 
 
240 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  42.67 
 
 
228 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  42.86 
 
 
230 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.46 
 
 
243 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.18 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.18 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  34.78 
 
 
296 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  40.08 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  41.67 
 
 
237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  40.71 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  38.89 
 
 
244 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  35.22 
 
 
227 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  38.98 
 
 
255 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
247 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  37.29 
 
 
245 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
238 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  41.56 
 
 
241 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  42.11 
 
 
241 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  39.74 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  36.65 
 
 
232 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.86 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  38.43 
 
 
266 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  34.4 
 
 
234 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37.33 
 
 
233 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
246 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  33.94 
 
 
234 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  35.15 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.57 
 
 
204 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  36.21 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  34.06 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  34.93 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  36.09 
 
 
230 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  35.37 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  35.37 
 
 
227 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
239 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
242 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  35.04 
 
 
227 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
242 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  38.56 
 
 
242 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.75 
 
 
230 aa  106  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  34.93 
 
 
227 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  34.5 
 
 
248 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  34.06 
 
 
227 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 
259 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  33.62 
 
 
227 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  33.62 
 
 
227 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  38.81 
 
 
247 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  33.62 
 
 
227 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  33.62 
 
 
227 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  33.62 
 
 
227 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  35.32 
 
 
245 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  38.7 
 
 
238 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  32.64 
 
 
286 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  33.62 
 
 
227 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  34.06 
 
 
227 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  38.67 
 
 
231 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  33.92 
 
 
241 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  33.93 
 
 
241 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  32.61 
 
 
233 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.63 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.48 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  32.63 
 
 
239 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
229 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  32.76 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  31.78 
 
 
233 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.99 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  32 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.5 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  33.92 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  29.57 
 
 
293 aa  95.9  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.68 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>