33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0097 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  47.13 
 
 
710 aa  684    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  100 
 
 
719 aa  1478    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  65.09 
 
 
723 aa  950    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  67.22 
 
 
720 aa  1020    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  40.27 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  30.97 
 
 
726 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  30.97 
 
 
726 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  29.22 
 
 
830 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  29.25 
 
 
830 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  27.89 
 
 
824 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  27.24 
 
 
660 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  28.16 
 
 
662 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  29.18 
 
 
662 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  23.09 
 
 
677 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  24.57 
 
 
662 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.9 
 
 
612 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  28.86 
 
 
601 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  26.56 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  26.11 
 
 
617 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.93 
 
 
607 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  26.72 
 
 
619 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  27.82 
 
 
607 aa  55.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  25.2 
 
 
615 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  24.28 
 
 
625 aa  52  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.67 
 
 
616 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  23.22 
 
 
593 aa  51.6  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.05 
 
 
593 aa  51.6  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  28.1 
 
 
631 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  24.9 
 
 
610 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 
671 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  23.75 
 
 
1136 aa  44.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  22.22 
 
 
613 aa  44.3  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  25.85 
 
 
541 aa  43.9  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>