More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0085 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  95.33 
 
 
364 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000393468  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  95.33 
 
 
364 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000994394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  95.33 
 
 
364 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  95.33 
 
 
364 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  95.33 
 
 
364 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000161378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  100 
 
 
364 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  95.6 
 
 
364 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327978  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  95.33 
 
 
364 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000255362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  95.33 
 
 
364 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000161007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  75.56 
 
 
363 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000013299  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  79.54 
 
 
365 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198948  unclonable  0.00000000000612342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  77.9 
 
 
380 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000040374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  77.62 
 
 
363 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000381417  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  76.67 
 
 
363 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000057895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  76.67 
 
 
363 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  76.11 
 
 
363 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000719173  decreased coverage  0.000000135353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  73.3 
 
 
376 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000118536  hitchhiker  0.0000000000000798373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  76.95 
 
 
391 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000156521  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  74.3 
 
 
401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221745  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  49.42 
 
 
359 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  49.27 
 
 
376 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  47.47 
 
 
354 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  47.47 
 
 
354 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 
354 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  46.63 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  46.63 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  46.91 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  46.63 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  46.63 
 
 
354 aa  319  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  46.35 
 
 
354 aa  315  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  44.1 
 
 
354 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  46.59 
 
 
353 aa  311  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 
354 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  47.69 
 
 
361 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1042  AraC family transcriptional regulator  50.42 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  48.99 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  44.13 
 
 
361 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  48.56 
 
 
360 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  47.67 
 
 
350 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  45.01 
 
 
366 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  47.03 
 
 
353 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  47.01 
 
 
352 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  47.11 
 
 
361 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  47.01 
 
 
352 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  47.01 
 
 
352 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3765  bifunctional DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  46.13 
 
 
354 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  45.87 
 
 
354 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  46.72 
 
 
352 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  43.82 
 
 
361 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  43.54 
 
 
361 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0501  transcriptional regulator, AraC family  49.85 
 
 
374 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  46.51 
 
 
350 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  46.26 
 
 
360 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  46.67 
 
 
350 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1307  transcriptional regulator, AraC family  47.08 
 
 
357 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  42.94 
 
 
384 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 
357 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  49.28 
 
 
358 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  44.89 
 
 
354 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1127  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  48.7 
 
 
351 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.836162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  44.06 
 
 
368 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  46.02 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  47.85 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 
366 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0834  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  45.45 
 
 
340 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3551  AraC family transcriptional regulator  48.17 
 
 
369 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0783013  normal  0.874169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  48.53 
 
 
380 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
345 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4687  transcriptional regulator, AraC family  48.24 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3753  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  44.75 
 
 
363 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.2777  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1283  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  41.4 
 
 
344 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0991  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  48.92 
 
 
295 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46280  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  44.19 
 
 
355 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6249  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  43.26 
 
 
388 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2772  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 
313 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353019  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2956  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  42.91 
 
 
303 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0076  adaptative response regulatory protein Ada  41.04 
 
 
273 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1108  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  34.48 
 
 
348 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000971871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0019  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  37.86 
 
 
360 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1950  transcriptional regulator, AraC family  44.17 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0849  ADA regulatory protein  33.24 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2158  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  35.12 
 
 
360 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0128  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  34.73 
 
 
361 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17760  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  38.11 
 
 
357 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0045  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  34.57 
 
 
348 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.218349  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1546  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  38.29 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.939179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0066  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  35.13 
 
 
357 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  decreased coverage  0.00876972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1745  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  33.82 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00607574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0234  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  35.38 
 
 
354 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0549  transcriptional regulator, AraC family  37.73 
 
 
289 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1575  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.53 
 
 
282 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0721  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  38.43 
 
 
279 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2162  AraC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
306 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235913  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3288  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  35.61 
 
 
351 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575953  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1156  hypothetical protein  33.43 
 
 
356 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3024  ADA regulatory protein  40.22 
 
 
287 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697686  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3879  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  39.03 
 
 
293 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.612619  normal  0.1278 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1152  hypothetical protein  33.43 
 
 
356 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2682  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  36.57 
 
 
354 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100688  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3799  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  33.7 
 
 
282 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>