174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0075 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3812  recombinase  60.04 
 
 		 523 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  100 
 
 		 521 aa  1079    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  88.29 
 
 		 537 aa  931    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  78.54 
 
 		 521 aa  820    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  77.13 
 
 		 521 aa  795    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  74.8 
 
 		 521 aa  788    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  77.13 
 
 		 521 aa  795    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  60.04 
 
 		 523 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  61.48 
 
 		 497 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  60 
 
 		 524 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  56.8 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  56.8 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  56.29 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  56.09 
 
 		 528 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  43.85 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  43.85 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  44.05 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  45.07 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  45.58 
 
 		 534 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  42.23 
 
 		 518 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  45.4 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  46.15 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  81.03 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  58.09 
 
 		 328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  41.23 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  56.32 
 
 		 157 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.95 
 
 		 517 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  29.94 
 
 		 563 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.61 
 
 		 547 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.71 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.75 
 
 		 506 aa  91.3  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.81 
 
 		 510 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.16 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.16 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.38 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  29.89 
 
 		 564 aa  81.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  24.59 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.56 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.97 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.41 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.17 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.92 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.4 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.45 
 
 		 539 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.16 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.88 
 
 		 613 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.82 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.03 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  28.91 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.14 
 
 		 579 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  27.22 
 
 		 738 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.77 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23.37 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.22 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.34 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 524 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.47 
 
 		 537 aa  67  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.89 
 
 		 578 aa  67  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.6 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.13 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  24.4 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  24.67 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.02 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.04 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.82 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.7 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.59 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.82 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.47 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.46 
 
 		 549 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.47 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  27.6 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.69 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.86 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.28 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.24 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  26.03 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.13 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.04 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.41 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.41 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.49 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  32.52 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  30.67 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.7 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.63 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>