More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0043 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  96.99 
 
 
366 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  97.54 
 
 
366 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  97.54 
 
 
366 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  97.54 
 
 
366 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  97.54 
 
 
366 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
366 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  97.54 
 
 
366 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  97.54 
 
 
366 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  50.95 
 
 
363 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  51.37 
 
 
362 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  50.28 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  50.95 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  51.79 
 
 
362 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  49.72 
 
 
362 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  50.4 
 
 
363 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  52 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  49.03 
 
 
362 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  48.77 
 
 
362 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  43.37 
 
 
351 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  39.7 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  39.12 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  37.47 
 
 
387 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  39.31 
 
 
387 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  36.25 
 
 
379 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  34.94 
 
 
396 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.88 
 
 
383 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.72 
 
 
383 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  34.88 
 
 
388 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.25 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.74 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  35.64 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.25 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.8 
 
 
381 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.34 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35.34 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.31 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  35.32 
 
 
379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  35.07 
 
 
379 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  35.07 
 
 
379 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  35.62 
 
 
422 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  35.07 
 
 
379 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  34.04 
 
 
369 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  35.07 
 
 
379 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.07 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.08 
 
 
385 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  33.83 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  35.98 
 
 
383 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  35.89 
 
 
387 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  34.73 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  34.73 
 
 
382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  35.82 
 
 
379 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  35.36 
 
 
424 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  34.6 
 
 
377 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.35 
 
 
381 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.25 
 
 
375 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  35.29 
 
 
379 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  33.75 
 
 
387 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  34.66 
 
 
375 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  35.29 
 
 
383 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  35.29 
 
 
383 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  34.74 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  34.74 
 
 
379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  33.9 
 
 
380 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  33.9 
 
 
380 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  33.9 
 
 
383 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  33.9 
 
 
383 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  33.9 
 
 
383 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  33.9 
 
 
383 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  33.9 
 
 
383 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  34.57 
 
 
369 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  34.11 
 
 
379 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  34.06 
 
 
383 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  33.85 
 
 
379 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  35 
 
 
385 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  34.09 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  33.59 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  33.59 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  33.59 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  33.82 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  33.9 
 
 
481 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  34.17 
 
 
389 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  34.41 
 
 
384 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  35.05 
 
 
383 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  33.84 
 
 
374 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  34.45 
 
 
391 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  33.25 
 
 
381 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  34.47 
 
 
387 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  33.25 
 
 
382 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  33.25 
 
 
382 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  33.68 
 
 
387 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  34.56 
 
 
380 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  33.41 
 
 
436 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  35.52 
 
 
380 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.41 
 
 
436 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.41 
 
 
386 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.41 
 
 
386 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.41 
 
 
386 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  33.41 
 
 
386 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>