27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0010 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0010  GspC  100 
 
 		 136 aa  270  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2783  general secretion pathway protein C  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2665  general secretion pathway protein C  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0223  GspC  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0010  general secretion pathway protein C  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0010  general secretion pathway protein C  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1887  general secretion pathway protein C  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.730387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3515  general secretion pathway protein C  96.32 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0049  general secretion pathway protein C  81.62 
 
 		 136 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0059  hypothetical protein  80.15 
 
 		 136 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0011  hypothetical protein  80.15 
 
 		 136 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0060  hypothetical protein  84.56 
 
 		 136 aa  186  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0078  hypothetical protein  81.62 
 
 		 136 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3241  hypothetical protein  81.62 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0059  general secretion pathway protein C  80.88 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3073  putative general secretory pathway protein C  64.23 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4498  putative general secretory pathway protein C  64.96 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3939  putative general secretory pathway protein C  63.5 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3390  putative general secretion pathway related transmembrane protein  48.48 
 
 		 227 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3043  putative general secretion pathway related transmembrane protein  48.48 
 
 		 227 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.429926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  44.7 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  44.53 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1072  hypothetical protein  51.65 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904163  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3105  putative general secretion pathway related transmembrane protein  42.52 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79717  normal  0.98729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1901  putative general secretion pathway related transmembrane protein  38.24 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4163  hypothetical protein  36.92 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.962185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3194  putative general secretion pathway protein C  30.3 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.122783  hitchhiker  0.00278841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>