More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4947 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  100 
 
 
304 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  97.04 
 
 
304 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  74.34 
 
 
302 aa  495  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.03 
 
 
303 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.03 
 
 
303 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.68 
 
 
304 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.03 
 
 
303 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  72.7 
 
 
303 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.68 
 
 
302 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  70.72 
 
 
299 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  71.71 
 
 
302 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  54.64 
 
 
313 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  54.24 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  41.83 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  41.23 
 
 
318 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.23 
 
 
318 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.81 
 
 
337 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.18 
 
 
338 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  43.27 
 
 
374 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  40 
 
 
338 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.67 
 
 
383 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  40.85 
 
 
338 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  39.47 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  39.47 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  40.58 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  40.58 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  40.58 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  40.58 
 
 
333 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.06 
 
 
333 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  39.8 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  39.8 
 
 
338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  39.8 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  40.26 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  39.62 
 
 
333 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  39.42 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  37.83 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  37.46 
 
 
377 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  37.46 
 
 
377 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.79 
 
 
333 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  39.13 
 
 
374 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  37.8 
 
 
372 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  37.89 
 
 
374 aa  192  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.18 
 
 
335 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  35.74 
 
 
435 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  42.06 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
375 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
375 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  42.06 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  42.06 
 
 
375 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.05 
 
 
488 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.63 
 
 
374 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  38.25 
 
 
408 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.34 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  36.51 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  37.5 
 
 
399 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  36.89 
 
 
399 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.67 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  37.2 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.67 
 
 
401 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
398 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  35.47 
 
 
400 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  33.63 
 
 
427 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  35.17 
 
 
398 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
398 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  35.17 
 
 
398 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  35.17 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.98 
 
 
388 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  36.28 
 
 
392 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  38.57 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.12 
 
 
322 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  33.55 
 
 
296 aa  157  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  35.56 
 
 
345 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  35.26 
 
 
345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  33.54 
 
 
345 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  32.56 
 
 
410 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  34.06 
 
 
345 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.45 
 
 
345 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  33.64 
 
 
345 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  33.23 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  33.23 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  33.23 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  33.23 
 
 
345 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.16 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.11 
 
 
303 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.74 
 
 
344 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  31.33 
 
 
412 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  33.09 
 
 
405 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  33.09 
 
 
405 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 
445 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  43.64 
 
 
434 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  32.4 
 
 
450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.78 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0211  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.71 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  32.55 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 
414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>