148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4447 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  100 
 
 
164 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 
164 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  99.39 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  98.78 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  98.78 
 
 
164 aa  333  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  95.12 
 
 
164 aa  303  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  93.29 
 
 
164 aa  298  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  99.29 
 
 
153 aa  285  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  91.82 
 
 
159 aa  284  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  98.52 
 
 
148 aa  275  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  71.7 
 
 
159 aa  249  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  56.69 
 
 
158 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  54.78 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  54.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  54.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  54.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  54.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  54.14 
 
 
158 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  54.14 
 
 
158 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  54.14 
 
 
158 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  54.14 
 
 
158 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  53.95 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  48.41 
 
 
158 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  48.68 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  42.68 
 
 
158 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  43.95 
 
 
158 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  43.62 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  40.76 
 
 
161 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  43.23 
 
 
158 aa  140  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  47.2 
 
 
155 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  39.49 
 
 
159 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  38.12 
 
 
176 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  38.22 
 
 
162 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  38.22 
 
 
162 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  38.22 
 
 
162 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  38.22 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  46.1 
 
 
159 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  36.94 
 
 
162 aa  131  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  36.94 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  38.46 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  42.07 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  38.85 
 
 
160 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  38.85 
 
 
160 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  40.13 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  37.58 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  37.18 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  35.03 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  35.67 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  36.94 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  37.18 
 
 
160 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  36.31 
 
 
162 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  37.58 
 
 
163 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  36.54 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  36.54 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  39.38 
 
 
161 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  36.71 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  36.71 
 
 
161 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  35.26 
 
 
160 aa  121  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  35.26 
 
 
160 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  37.16 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  40.88 
 
 
171 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  37.27 
 
 
174 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  34.62 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  34.62 
 
 
161 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  33.97 
 
 
160 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  34.9 
 
 
160 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  34.62 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  33.76 
 
 
160 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  33.76 
 
 
160 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  34.18 
 
 
160 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  33.33 
 
 
160 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  32.48 
 
 
159 aa  110  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  36.36 
 
 
198 aa  110  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  35.71 
 
 
197 aa  108  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  31.41 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  32.24 
 
 
186 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  35.9 
 
 
160 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  35.67 
 
 
160 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  35.25 
 
 
160 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  33.54 
 
 
159 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  33.54 
 
 
171 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  33.54 
 
 
171 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  33.54 
 
 
171 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  33.54 
 
 
171 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  33.54 
 
 
162 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  34.53 
 
 
208 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  32.21 
 
 
188 aa  87.8  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  28.57 
 
 
191 aa  84.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  27.15 
 
 
171 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  25.5 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  26.58 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0123  CarD family transcriptional regulator  29.3 
 
 
192 aa  77.4  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0412  transcription factor CarD  30.72 
 
 
283 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595911  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  31.76 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0187  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160759  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  30.57 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  30.57 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  31.37 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  31.16 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>