206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4060 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  97.92 
 
 
336 aa  641    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  99.7 
 
 
336 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
336 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  99.4 
 
 
336 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  97.92 
 
 
336 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  99.7 
 
 
336 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  98.21 
 
 
336 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  99.7 
 
 
336 aa  673    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  98.21 
 
 
336 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  96.43 
 
 
336 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  91.67 
 
 
336 aa  607  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  52.25 
 
 
344 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  47.46 
 
 
348 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  38.32 
 
 
324 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  38.32 
 
 
324 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  33.83 
 
 
343 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  37.35 
 
 
324 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  35.4 
 
 
323 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  30.42 
 
 
333 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.78 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  28.78 
 
 
334 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  30.19 
 
 
331 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.9 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.88 
 
 
329 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.58 
 
 
334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  28.53 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  30.38 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.46 
 
 
337 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  30.65 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  28.45 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.63 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  31.23 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.19 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  29.7 
 
 
336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.11 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  25.22 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  28.87 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 
345 aa  126  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.25 
 
 
315 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  27.59 
 
 
335 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  28.34 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  31.56 
 
 
336 aa  119  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  28.96 
 
 
336 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 
334 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  28.1 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 
339 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  29.66 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.3 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.9 
 
 
344 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.81 
 
 
325 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 
374 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 
341 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 
338 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  25.77 
 
 
348 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.29 
 
 
332 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 
338 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  25.46 
 
 
348 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.64 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.62 
 
 
419 aa  92.8  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.46 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.84 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  21.76 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  22.64 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  23.62 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  26.23 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.58 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  27.24 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  25.19 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  29.95 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  19.06 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  24.63 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.39 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  23.19 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.12 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  29.63 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf317  DNA polymerase III, delta subunit  20.73 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  23.65 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  26.04 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  29.13 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  25.67 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>