More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3966 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
124 aa  241  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  99.19 
 
 
124 aa  241  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  99.19 
 
 
124 aa  241  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  98.39 
 
 
124 aa  239  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  98.39 
 
 
124 aa  238  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  96.77 
 
 
124 aa  233  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  86.29 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  56.56 
 
 
125 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  49.19 
 
 
126 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  49.19 
 
 
126 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  50 
 
 
129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
129 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  52 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 
124 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
125 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
123 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
123 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  47.58 
 
 
129 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  51.61 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  46.77 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  44.26 
 
 
125 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  46.61 
 
 
124 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  38.84 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  48.68 
 
 
126 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  34.43 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  44.58 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  39.32 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.29 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
477 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  41.18 
 
 
479 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.11 
 
 
490 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
477 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
477 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  30.08 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  31.62 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  32.74 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  41.77 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.55 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  31.86 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
477 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  36.84 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  35.9 
 
 
321 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>