More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3093 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 
120 aa  237  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  97.5 
 
 
120 aa  234  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  96.67 
 
 
120 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  95 
 
 
120 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  95 
 
 
120 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  95 
 
 
120 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  55.14 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 
106 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  47.12 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 
107 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  50.96 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  50.96 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  50.96 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  50.96 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  50.96 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  50.96 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  50 
 
 
107 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  50 
 
 
107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 
109 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  50 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  52.34 
 
 
107 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  51.16 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  50 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  39.81 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 
109 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 
110 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 
110 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.31 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  38.53 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  38.84 
 
 
136 aa  90.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 
109 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  39.62 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  45.87 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.67 
 
 
110 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  41.35 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
110 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.12 
 
 
107 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.19 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.19 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  38.39 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  40.38 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 
109 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 
107 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  38 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  46.34 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  38.68 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.74 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  46.88 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  45.35 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  40.74 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  36.79 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  36.79 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  36.79 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1110  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200886  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  35.78 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  40 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  30.48 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  39.81 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  41 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  40 
 
 
115 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  41 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  41 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  38.89 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  41.35 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>