More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2460 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  86.44 
 
 
376 aa  666    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  91.76 
 
 
376 aa  706    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  95.21 
 
 
376 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
376 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  95.21 
 
 
376 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  95.21 
 
 
376 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  85.9 
 
 
376 aa  663    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  82.98 
 
 
376 aa  634    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  96.01 
 
 
376 aa  733    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  94.41 
 
 
376 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.36 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  40.84 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  40.84 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 
379 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 
379 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 
379 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 
379 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 
379 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 
381 aa  299  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 
379 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 
379 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
378 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 
377 aa  272  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 
377 aa  272  9e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  37.3 
 
 
377 aa  269  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.13 
 
 
380 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.25 
 
 
378 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.71 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.29 
 
 
370 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.57 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.57 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  34.13 
 
 
378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  32.55 
 
 
376 aa  210  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 
374 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.04 
 
 
365 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.28 
 
 
378 aa  203  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.03 
 
 
380 aa  202  7e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 
370 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 
366 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 
367 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.16 
 
 
367 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 
365 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  26.12 
 
 
370 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 
366 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.4 
 
 
367 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 
385 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 
385 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 
385 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.55 
 
 
366 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  26.46 
 
 
369 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.08 
 
 
374 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  26.3 
 
 
393 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  26.3 
 
 
393 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.41 
 
 
385 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.23 
 
 
385 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.28 
 
 
370 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.21 
 
 
385 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.05 
 
 
377 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 
365 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.71 
 
 
397 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.65 
 
 
377 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  27.91 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 
372 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.04 
 
 
382 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25.58 
 
 
374 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  28.47 
 
 
394 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.49 
 
 
375 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  25.32 
 
 
378 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.49 
 
 
375 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 
387 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 
389 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 
376 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 
375 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.38 
 
 
388 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 
369 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.69 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  23.83 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.37 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  27.79 
 
 
371 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.85 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  25.83 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.62 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  25.58 
 
 
378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.76 
 
 
369 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 
372 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 
370 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 
372 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.04 
 
 
367 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.04 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  23.08 
 
 
366 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  24.07 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  24.28 
 
 
372 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  24.28 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  24.28 
 
 
372 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 
373 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>