More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2260 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  99.4 
 
 
333 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  100 
 
 
333 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  98.8 
 
 
333 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  99.4 
 
 
333 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  100 
 
 
333 aa  676    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  97.9 
 
 
333 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  96.4 
 
 
333 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  93.99 
 
 
333 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  94.59 
 
 
333 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  61.01 
 
 
346 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  61.01 
 
 
346 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02984  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0586  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0581  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4430  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.119659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3591  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3240  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3305  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0825845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02935  hypothetical protein  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3413  threonine dehydratase  59.19 
 
 
329 aa  346  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3564  threonine dehydratase  58.57 
 
 
329 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3602  threonine dehydratase  58.26 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3539  threonine dehydratase  58.26 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00163646  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3435  threonine dehydratase  58.26 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3506  threonine dehydratase  58.26 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3432  threonine dehydratase  58.26 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  50.31 
 
 
403 aa  318  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  48.9 
 
 
405 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  51.91 
 
 
402 aa  292  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  45.03 
 
 
402 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  49.53 
 
 
408 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  50.47 
 
 
403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  44.72 
 
 
402 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  47.98 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  50.31 
 
 
401 aa  286  4e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  47.94 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  46.73 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  51.11 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  46.23 
 
 
403 aa  281  9e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  44.2 
 
 
403 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  47.16 
 
 
400 aa  279  4e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  45.6 
 
 
403 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  45.14 
 
 
402 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  45.28 
 
 
403 aa  276  4e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  50.95 
 
 
402 aa  276  4e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  47.5 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  50.16 
 
 
401 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  50.16 
 
 
401 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  43.21 
 
 
403 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  48.25 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  44.41 
 
 
408 aa  268  8e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  45.37 
 
 
402 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  48.15 
 
 
402 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  52.33 
 
 
404 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.86 
 
 
415 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  46.54 
 
 
412 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.82 
 
 
320 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  46.11 
 
 
402 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  47.8 
 
 
401 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  42.14 
 
 
403 aa  261  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.08 
 
 
403 aa  260  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.51 
 
 
403 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  47.96 
 
 
404 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  45.89 
 
 
412 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  46.25 
 
 
406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.89 
 
 
404 aa  258  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.83 
 
 
403 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.89 
 
 
403 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  43.56 
 
 
501 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  48.59 
 
 
405 aa  255  8e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  43.38 
 
 
514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  47.72 
 
 
415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  46.84 
 
 
443 aa  252  7e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.17 
 
 
399 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4000  serine/threonine dehydratase  46.96 
 
 
325 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4113  serine/threonine dehydratase  46.96 
 
 
325 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  0.528842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  46.25 
 
 
408 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  46.71 
 
 
412 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  46.5 
 
 
411 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  48.3 
 
 
410 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  48.14 
 
 
402 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  40.88 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  45.08 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  42.16 
 
 
507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  42.62 
 
 
526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.79 
 
 
400 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  41.91 
 
 
514 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.77 
 
 
321 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  46.41 
 
 
404 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  42.72 
 
 
531 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  42.24 
 
 
506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  42.24 
 
 
506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  41.91 
 
 
501 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.64 
 
 
409 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  41.58 
 
 
509 aa  242  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  42.24 
 
 
511 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.44 
 
 
332 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  46.73 
 
 
403 aa  240  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  41.91 
 
 
511 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  40.73 
 
 
507 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>