74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_1724 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  100 
 
 
101 aa  197  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  90 
 
 
365 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  91 
 
 
608 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  91 
 
 
608 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  91 
 
 
608 aa  180  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  91 
 
 
608 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  90 
 
 
608 aa  180  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  90 
 
 
608 aa  180  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  90 
 
 
608 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  77 
 
 
608 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  79 
 
 
608 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  79.8 
 
 
585 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  63.64 
 
 
609 aa  124  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  60.61 
 
 
609 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  60.61 
 
 
609 aa  123  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  63.64 
 
 
612 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  54.95 
 
 
611 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  60.23 
 
 
615 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  45.83 
 
 
611 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  53.76 
 
 
614 aa  86.7  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  45.16 
 
 
627 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  64.13 
 
 
614 aa  80.9  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  45 
 
 
614 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  44.21 
 
 
654 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  44.68 
 
 
658 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  42.57 
 
 
627 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  50.57 
 
 
685 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  46.07 
 
 
683 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  44.57 
 
 
682 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  41.35 
 
 
612 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  45 
 
 
614 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  44.44 
 
 
655 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  50 
 
 
674 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  40.21 
 
 
653 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  44 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  46.88 
 
 
667 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.44 
 
 
781 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  43.48 
 
 
731 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 
750 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  43.48 
 
 
677 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  41.94 
 
 
668 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  44.09 
 
 
678 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  48.35 
 
 
691 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  48.35 
 
 
696 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  48.86 
 
 
681 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  47.73 
 
 
704 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  41.76 
 
 
636 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  42.53 
 
 
664 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 
664 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 
664 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  49.44 
 
 
677 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 
664 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 
664 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  42.7 
 
 
672 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  43.48 
 
 
672 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  45.21 
 
 
619 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  45.35 
 
 
615 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  48.28 
 
 
672 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  43.68 
 
 
678 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  44.57 
 
 
667 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  41.3 
 
 
693 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  41.11 
 
 
657 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  39.13 
 
 
674 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.11 
 
 
777 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  39.6 
 
 
629 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  41.58 
 
 
629 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  43.21 
 
 
470 aa  58.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.92 
 
 
647 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  38.2 
 
 
622 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  33.75 
 
 
650 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.05 
 
 
774 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.01 
 
 
815 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  45.9 
 
 
713 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  45.9 
 
 
713 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>