More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_0998 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  93.61 
 
 
313 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  96.49 
 
 
313 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  96.17 
 
 
313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.49 
 
 
316 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.71 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.91 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.39 
 
 
319 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.21 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.51 
 
 
315 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.48 
 
 
315 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.62 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
231 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
230 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.21 
 
 
235 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.21 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.4 
 
 
230 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  34.21 
 
 
237 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  35.4 
 
 
229 aa  123  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7257  helix-turn-helix type 11 domain protein  34.21 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.38 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.77 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.39 
 
 
312 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.02 
 
 
230 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.55 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  34.71 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.64 
 
 
228 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.64 
 
 
228 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3521  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.19 
 
 
231 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  31.44 
 
 
231 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  34.11 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.11 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.11 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  29.28 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  29.28 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  34.11 
 
 
228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.6 
 
 
302 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  27.89 
 
 
339 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  33.91 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  34.35 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  27.99 
 
 
320 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  29.82 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  29.24 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  27.47 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 
233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1376  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.15 
 
 
328 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.13 
 
 
233 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  29.9 
 
 
311 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.3 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  33.17 
 
 
232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 
234 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  28.19 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.17 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  31.58 
 
 
230 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  30.13 
 
 
234 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  31.58 
 
 
230 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  31.58 
 
 
230 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  26.3 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.43 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.59 
 
 
321 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  31.58 
 
 
231 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.08 
 
 
302 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.72 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.6 
 
 
229 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
314 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  32.03 
 
 
323 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.51 
 
 
328 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.52 
 
 
232 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2679  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.11 
 
 
228 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.72 
 
 
323 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  30.51 
 
 
228 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  30.51 
 
 
228 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  30 
 
 
320 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.52 
 
 
232 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  31 
 
 
229 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31 
 
 
240 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  29.52 
 
 
232 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.33 
 
 
317 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.41 
 
 
237 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1262  hypothetical protein  34.58 
 
 
228 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.86 
 
 
326 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.33 
 
 
321 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.67 
 
 
327 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  26.17 
 
 
317 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.35 
 
 
323 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.74 
 
 
232 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  25.86 
 
 
317 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2370  hypothetical protein  34.58 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  25.86 
 
 
317 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3390  transcriptional regulator (repressor protein)  34.58 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.34 
 
 
233 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1146  hypothetical protein  34.58 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0387023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2550  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 
228 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0284  hypothetical protein  34.58 
 
 
361 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  26.65 
 
 
317 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  29.65 
 
 
230 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  26.4 
 
 
317 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  26.17 
 
 
317 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.9 
 
 
320 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2539  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.71 
 
 
228 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>