More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_0841 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  100 
 
 
373 aa  756    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.32 
 
 
328 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  39.73 
 
 
305 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 
417 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  37.77 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  36.19 
 
 
417 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  36.11 
 
 
491 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  36.32 
 
 
323 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  35.37 
 
 
474 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  35.39 
 
 
416 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  34.49 
 
 
436 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  34.13 
 
 
406 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  35.22 
 
 
419 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  32.82 
 
 
426 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  34.88 
 
 
472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  34.7 
 
 
417 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  36.84 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  34.63 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  34.63 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.75 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  34.63 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  34.63 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  34.31 
 
 
476 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  33.59 
 
 
428 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  34.63 
 
 
472 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  34.3 
 
 
476 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  34.3 
 
 
476 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  34.3 
 
 
476 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  34.3 
 
 
476 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 
318 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  34.37 
 
 
472 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  35.66 
 
 
425 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  33.94 
 
 
447 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.99 
 
 
418 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  34.74 
 
 
471 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  34.21 
 
 
415 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  33.78 
 
 
487 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
324 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  31.85 
 
 
727 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  33.06 
 
 
311 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  30.29 
 
 
327 aa  138  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
329 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  44.57 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.24 
 
 
451 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  32.08 
 
 
329 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.7 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  40.62 
 
 
657 aa  133  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  40.89 
 
 
438 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  37.29 
 
 
336 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 
350 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.13 
 
 
320 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  28.87 
 
 
352 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.58 
 
 
423 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  29.92 
 
 
417 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  36.61 
 
 
413 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  25.49 
 
 
444 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  35.68 
 
 
467 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
460 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
460 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 
483 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
335 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
456 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
456 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  36.02 
 
 
381 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  34.04 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 
415 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.25 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.86 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.06 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  26.67 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  30.32 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.43 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.74 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 
424 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 
490 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.75 
 
 
308 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 
421 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
321 aa  89  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  25.49 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.09 
 
 
313 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 
393 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  32.68 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.97 
 
 
431 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 
335 aa  87  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>