247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1190 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 
661 aa  1357    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  62.03 
 
 
665 aa  811    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  99.08 
 
 
654 aa  1332    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  29.6 
 
 
644 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 
652 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
644 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  27.91 
 
 
644 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 
743 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
756 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 
649 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
681 aa  180  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.3 
 
 
657 aa  178  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
752 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  27.51 
 
 
652 aa  173  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  28.54 
 
 
490 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 
668 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
693 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  26.72 
 
 
659 aa  158  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
654 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  25.14 
 
 
668 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
667 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  25.85 
 
 
693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.48 
 
 
677 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
687 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.73 
 
 
697 aa  126  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.12 
 
 
695 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.63 
 
 
681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 
684 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.59 
 
 
696 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.47 
 
 
690 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.83 
 
 
696 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  32.64 
 
 
646 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  22.66 
 
 
668 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.8 
 
 
696 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  23.48 
 
 
697 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.35 
 
 
688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
683 aa  111  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.31 
 
 
696 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.44 
 
 
696 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 
300 aa  107  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  22.78 
 
 
692 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.8 
 
 
704 aa  97.4  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.57 
 
 
734 aa  94.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.38 
 
 
859 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.28 
 
 
759 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.45 
 
 
849 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.39 
 
 
694 aa  87.8  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.78 
 
 
861 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.28 
 
 
862 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.4 
 
 
676 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.86 
 
 
661 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  21.5 
 
 
683 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.36 
 
 
862 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  29.55 
 
 
857 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  31.4 
 
 
676 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.4 
 
 
676 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.44 
 
 
862 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  28.63 
 
 
730 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  22.69 
 
 
698 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  30.81 
 
 
676 aa  78.2  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.56 
 
 
689 aa  77.8  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.59 
 
 
669 aa  77.4  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  27.59 
 
 
764 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.36 
 
 
867 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.1 
 
 
744 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  21.47 
 
 
660 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  27.59 
 
 
764 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  28.25 
 
 
660 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.77 
 
 
778 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 
374 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.53 
 
 
783 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.6 
 
 
739 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.44 
 
 
739 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  23.08 
 
 
728 aa  71.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.8 
 
 
739 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  26.68 
 
 
778 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.19 
 
 
739 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  27.61 
 
 
712 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  31.16 
 
 
737 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  29.51 
 
 
800 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  29.32 
 
 
851 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.84 
 
 
737 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.98 
 
 
694 aa  68.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.05 
 
 
737 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.77 
 
 
892 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  27.91 
 
 
771 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.36 
 
 
892 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  24.11 
 
 
314 aa  65.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.24 
 
 
685 aa  64.3  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.2 
 
 
779 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  22.56 
 
 
631 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  27.81 
 
 
851 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.24 
 
 
749 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0115  tonB-dependent receptor  26.25 
 
 
753 aa  62.4  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  27.03 
 
 
744 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.61 
 
 
755 aa  61.6  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  25.68 
 
 
693 aa  61.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  27.57 
 
 
744 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.84 
 
 
686 aa  60.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 
602 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>