More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1179 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  69.67 
 
 		 247 aa  345  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.1 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.2 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  37.99 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.05 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.9 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3791  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.31 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>