More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1012 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  95.93 
 
 		 492 aa  962    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 492 aa  1005    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 479 aa  981    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  53.52 
 
 		 493 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  50.7 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  51.6 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  49.9 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  51.06 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  49.15 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  48.87 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  47.33 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  45.03 
 
 		 495 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  45.11 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  45.11 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  42.49 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  43.92 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  44.6 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  41.4 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.14 
 
 		 507 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  36.68 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  37.42 
 
 		 506 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 507 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.31 
 
 		 526 aa  287  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 		 499 aa  281  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  33.91 
 
 		 505 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 515 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 522 aa  226  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  32.34 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.29 
 
 		 510 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 512 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 512 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 512 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  30.79 
 
 		 539 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 		 510 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.53 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  35.37 
 
 		 522 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  35.5 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  33.26 
 
 		 534 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  35.88 
 
 		 541 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  33.33 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 510 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.19 
 
 		 505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  31.09 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  30.89 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  30.69 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  30.69 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  30.69 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  31.3 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.36 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.99 
 
 		 509 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.36 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.36 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.36 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.58 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 		 514 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.26 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 495 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.78 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.26 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.26 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.26 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.26 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.79 
 
 		 493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  31.66 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  29.38 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.64 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 536 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 505 aa  183  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  32.22 
 
 		 526 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 517 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  33 
 
 		 517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 		 528 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 495 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 		 520 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  34.2 
 
 		 520 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.52 
 
 		 532 aa  179  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.08 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>