245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0999 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  55.25 
 
 		 681 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  58.15 
 
 		 688 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  57.23 
 
 		 719 aa  791    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  52.05 
 
 		 726 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  100 
 
 		 676 aa  1388    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  58.15 
 
 		 688 aa  790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  52.23 
 
 		 745 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  53.38 
 
 		 684 aa  740    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  55.56 
 
 		 686 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  52.38 
 
 		 749 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  51.65 
 
 		 669 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  57.89 
 
 		 688 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  54.37 
 
 		 710 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  50.84 
 
 		 710 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  51.82 
 
 		 710 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  52.45 
 
 		 753 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  51.14 
 
 		 713 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  52.23 
 
 		 745 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  52.38 
 
 		 749 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  49.85 
 
 		 724 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  50.84 
 
 		 710 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  99.85 
 
 		 676 aa  1385    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  57.33 
 
 		 688 aa  783    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  55.4 
 
 		 681 aa  731    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  50.76 
 
 		 687 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  50.61 
 
 		 709 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  57.23 
 
 		 723 aa  792    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  50.84 
 
 		 710 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  49.41 
 
 		 687 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  50.7 
 
 		 725 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  52.23 
 
 		 745 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  50.7 
 
 		 698 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  52.22 
 
 		 745 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  48.59 
 
 		 691 aa  611  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  41.94 
 
 		 686 aa  515  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.5 
 
 		 661 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.21 
 
 		 662 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  38.35 
 
 		 667 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  35.69 
 
 		 668 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.42 
 
 		 663 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.26 
 
 		 668 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  36.95 
 
 		 668 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  36.01 
 
 		 667 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  31.26 
 
 		 695 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 672 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 		 665 aa  264  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 697 aa  211  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 699 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 768 aa  177  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 681 aa  173  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  23.64 
 
 		 699 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 668 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 661 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 760 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 698 aa  117  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 684 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 673 aa  115  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 718 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 696 aa  105  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 702 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.09 
 
 		 625 aa  99.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 716 aa  97.8  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 		 713 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 685 aa  94  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 685 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 744 aa  91.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 793 aa  91.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  23.09 
 
 		 701 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 702 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 780 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 741 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 713 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  21.48 
 
 		 713 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  21.53 
 
 		 708 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 766 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 713 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.38 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 692 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  50.75 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.76 
 
 		 669 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.44 
 
 		 859 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.51 
 
 		 628 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  21.06 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.03 
 
 		 775 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 725 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 693 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 677 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  28.84 
 
 		 857 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.06 
 
 		 712 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  24.92 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>