More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0945 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.83 
 
 
572 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  58.78 
 
 
581 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 
561 aa  1159    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  59.93 
 
 
567 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  60.11 
 
 
567 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  60.84 
 
 
567 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  59.93 
 
 
567 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  61.05 
 
 
567 aa  666    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  60.83 
 
 
567 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  60.33 
 
 
566 aa  690    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  60.18 
 
 
574 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  59.93 
 
 
567 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  58.89 
 
 
575 aa  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  59.93 
 
 
567 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  58.71 
 
 
575 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  59.75 
 
 
567 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  59.93 
 
 
567 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  57.56 
 
 
549 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  59.57 
 
 
567 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  56.23 
 
 
552 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  61.02 
 
 
567 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  59.64 
 
 
572 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  59.75 
 
 
567 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  60.29 
 
 
567 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  92.16 
 
 
564 aa  1060    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  56.41 
 
 
555 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  59.93 
 
 
567 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  55.96 
 
 
570 aa  634  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  57.75 
 
 
565 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  57.4 
 
 
565 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  54.83 
 
 
548 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  55.7 
 
 
557 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  55.6 
 
 
558 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  56.86 
 
 
552 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  57.22 
 
 
564 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  55.92 
 
 
550 aa  618  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  57.68 
 
 
559 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  56.96 
 
 
576 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  56.5 
 
 
572 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  55.22 
 
 
556 aa  611  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  55.76 
 
 
552 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.04 
 
 
568 aa  604  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  55.08 
 
 
556 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  58.05 
 
 
558 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  55.12 
 
 
582 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  54.07 
 
 
559 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  53.01 
 
 
567 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  55.15 
 
 
559 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  53.75 
 
 
580 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  51.79 
 
 
570 aa  587  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.64 
 
 
559 aa  585  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  53.16 
 
 
559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  53.6 
 
 
572 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  54.23 
 
 
558 aa  568  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  53.94 
 
 
553 aa  558  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  52.9 
 
 
567 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  52.72 
 
 
567 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  49.91 
 
 
564 aa  545  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  51.42 
 
 
566 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  46.56 
 
 
568 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  51.81 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  46.39 
 
 
567 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  44.77 
 
 
538 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  42.57 
 
 
552 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.13 
 
 
551 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  41.22 
 
 
551 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  41.7 
 
 
583 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.64 
 
 
543 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.55 
 
 
561 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.4 
 
 
565 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  38.55 
 
 
586 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.39 
 
 
560 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.88 
 
 
543 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  37.91 
 
 
587 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.97 
 
 
586 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.8 
 
 
588 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.38 
 
 
552 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.82 
 
 
567 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
564 aa  280  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.93 
 
 
562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.76 
 
 
569 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  30.11 
 
 
589 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  30.11 
 
 
589 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  33.01 
 
 
566 aa  270  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.58 
 
 
574 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.26 
 
 
554 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.87 
 
 
582 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.57 
 
 
602 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  34.05 
 
 
597 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.14 
 
 
555 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.68 
 
 
587 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.39 
 
 
588 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.14 
 
 
563 aa  263  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.7 
 
 
618 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  32.54 
 
 
569 aa  263  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.02 
 
 
581 aa  262  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.48 
 
 
619 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.31 
 
 
566 aa  262  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  32.67 
 
 
623 aa  262  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.02 
 
 
582 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>