More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0822 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  100 
 
 
913 aa  1842    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  95.57 
 
 
978 aa  1773    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.4 
 
 
1196 aa  862    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.94 
 
 
1261 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.99 
 
 
1263 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.3 
 
 
1226 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.65 
 
 
1260 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  45.73 
 
 
1275 aa  257  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  27.18 
 
 
1059 aa  183  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.29 
 
 
1110 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.39 
 
 
1012 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  38.71 
 
 
1086 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  42.44 
 
 
1134 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  41.1 
 
 
1105 aa  152  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  44.04 
 
 
1105 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 
1088 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  40.62 
 
 
1160 aa  147  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  50.65 
 
 
1242 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  43.58 
 
 
1081 aa  145  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.17 
 
 
1072 aa  144  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.66 
 
 
1110 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  49.66 
 
 
1145 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 
795 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  47.2 
 
 
1003 aa  130  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.02 
 
 
1199 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.77 
 
 
997 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.24 
 
 
884 aa  101  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.83 
 
 
831 aa  97.8  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  43.09 
 
 
1402 aa  97.8  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.08 
 
 
241 aa  94.7  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  43.59 
 
 
490 aa  94.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.38 
 
 
490 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
303 aa  92.8  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.46 
 
 
489 aa  92.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.41 
 
 
193 aa  92  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  36.42 
 
 
961 aa  92.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.02 
 
 
684 aa  91.7  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.94 
 
 
393 aa  91.3  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  90.5  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.25 
 
 
438 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  43.1 
 
 
557 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.5 
 
 
2413 aa  89.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  39.17 
 
 
271 aa  90.1  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.36 
 
 
1493 aa  89.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
181 aa  89  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.46 
 
 
254 aa  88.6  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.59 
 
 
232 aa  88.6  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  34.45 
 
 
235 aa  88.2  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  41.51 
 
 
416 aa  87.8  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.32 
 
 
680 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.5 
 
 
789 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
252 aa  86.7  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.83 
 
 
1037 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.18 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.79 
 
 
1475 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.14 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.44 
 
 
679 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  33.73 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.85 
 
 
425 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.46 
 
 
376 aa  83.2  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.34 
 
 
838 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  41.03 
 
 
839 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  34.3 
 
 
1910 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
223 aa  83.2  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.02 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.33 
 
 
218 aa  82.8  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.66 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.8 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  37.38 
 
 
274 aa  82  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  35.54 
 
 
295 aa  82  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  42.02 
 
 
685 aa  82  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  35.61 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.1 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.21 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.93 
 
 
376 aa  80.5  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  38.79 
 
 
342 aa  80.9  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.06 
 
 
255 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0145  Sel1 repeat-containing protein  37.88 
 
 
249 aa  80.1  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
1032 aa  79.7  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.79 
 
 
380 aa  80.1  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.91 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  27.95 
 
 
344 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 
763 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  27.96 
 
 
1877 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
976 aa  78.2  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.05 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.69 
 
 
1002 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
255 aa  77  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.19 
 
 
246 aa  77  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 
172 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  34.17 
 
 
536 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.83 
 
 
278 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  37.12 
 
 
315 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  32.24 
 
 
373 aa  76.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.83 
 
 
208 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.43 
 
 
731 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.51 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  36.19 
 
 
117 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>