More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0804 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1087    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  63.17 
 
 		 524 aa  693    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  63.36 
 
 		 524 aa  695    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  100 
 
 		 526 aa  1087    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  63.36 
 
 		 524 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  75.1 
 
 		 526 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  62.6 
 
 		 523 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  64.06 
 
 		 524 aa  695    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  63.36 
 
 		 524 aa  695    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2277  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding  68.8 
 
 		 553 aa  724    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0883096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  63.17 
 
 		 524 aa  693    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  63.17 
 
 		 524 aa  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  63.17 
 
 		 524 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  63.36 
 
 		 524 aa  695    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  58.2 
 
 		 524 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  57.4 
 
 		 538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  56.39 
 
 		 488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3342  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  56.74 
 
 		 524 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  53.16 
 
 		 532 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  49.04 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  47.5 
 
 		 544 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  42.83 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  43.45 
 
 		 539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  43.52 
 
 		 524 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  46.18 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  39.53 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  35.91 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  35.91 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2372  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  33.52 
 
 		 532 aa  336  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 526 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  32.85 
 
 		 538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  32.23 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 		 547 aa  212  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 		 544 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 555 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.77 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.51 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 		 542 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.47 
 
 		 524 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.06 
 
 		 520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49168  predicted protein  31.34 
 
 		 597 aa  167  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.48 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.44 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  29.19 
 
 		 560 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.65 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.16 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.96 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.12 
 
 		 534 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.4 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 550 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 511 aa  156  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.77 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.21 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.51 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 508 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.12 
 
 		 502 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 509 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  28.68 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.17 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  27.35 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.27 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  33.56 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.73 
 
 		 538 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.12 
 
 		 520 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 520 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.13 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.77 
 
 		 517 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  29.38 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  31.14 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  30.91 
 
 		 562 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>