More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0692 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0647  putative sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 
349 aa  711  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0692  sugar ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
349 aa  711  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.0072223  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.63 
 
 
293 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0253995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.25 
 
 
292 aa  517  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.47 
 
 
302 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.227216  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.53 
 
 
317 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.53 
 
 
317 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.85 
 
 
317 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573592  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.85 
 
 
317 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135276  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.98 
 
 
295 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1940  sugar ABC transporter permease  59.65 
 
 
310 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22990  putative permease of ABC sugar transporter  59.65 
 
 
310 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.155335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1554  ABC transporter, membrane permease  58.11 
 
 
357 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.15 
 
 
292 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.163293  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4072  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  58.16 
 
 
312 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0117098  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.43 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3050  carbohydrate ABC transporter permease  58.11 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1114  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.56 
 
 
302 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0784  carbohydrate ABC transporter permease  58.11 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1996  carbohydrate ABC transporter permease  58.11 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3084  ABC transporter, membrane permease  58.11 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2616  carbohydrate ABC transporter permease  58.11 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.43 
 
 
292 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2996  carbohydrate ABC transporter permease  58.11 
 
 
312 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.847023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.93 
 
 
309 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0310559  hitchhiker  0.000856592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.65 
 
 
302 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.125531  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.95 
 
 
309 aa  358  1e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20816  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.16 
 
 
312 aa  357  1e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.16 
 
 
312 aa  357  1e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.65 
 
 
298 aa  357  2e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.44 
 
 
293 aa  357  2e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.778407  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1293  glucose ABC transporter, permease protein, putative  60 
 
 
302 aa  356  3e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1957  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  57.75 
 
 
299 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104929  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
292 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.99 
 
 
289 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.67 
 
 
313 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4369  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.15 
 
 
302 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.276416  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.41 
 
 
290 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.07 
 
 
288 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0059104  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3450  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  58.08 
 
 
312 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.68646e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.99 
 
 
312 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213749  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.25 
 
 
294 aa  346  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.1 
 
 
302 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.1 
 
 
302 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00469845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.1 
 
 
302 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.39 
 
 
302 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
309 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
319 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.510445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
319 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
301 aa  253  2e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499107  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
301 aa  253  5e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485351  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
305 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
302 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0276286  normal  0.845621 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9199  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  45.68 
 
 
290 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
314 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.71 
 
 
300 aa  244  1e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.239524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
295 aa  244  1e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2082  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.58 
 
 
313 aa  244  1e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.785308  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
318 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 
335 aa  234  1e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
304 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
298 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0514652  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
302 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.473055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
307 aa  222  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.372981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
306 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
323 aa  214  2e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
330 aa  213  4e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.848651  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
330 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.817571  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
295 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
295 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.101772  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
323 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7938  ABC transporter (permease)  34.92 
 
 
295 aa  196  5e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
302 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26620  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.56 
 
 
300 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
299 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
298 aa  163  4e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
329 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
298 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
299 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
290 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
328 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
348 aa  152  9e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.519073 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
321 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.824924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
319 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
298 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
333 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
294 aa  141  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.58297e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
324 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
313 aa  135  1e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
305 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
299 aa  132  1e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
291 aa  131  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.43 
 
 
317 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
309 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
319 aa  130  4e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172357  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
374 aa  128  2e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
309 aa  128  2e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  29.54 
 
 
307 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
306 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
307 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>