More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0648 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  80.46 
 
 		 390 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  100 
 
 		 390 aa  793    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  84.06 
 
 		 390 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  95.13 
 
 		 390 aa  765    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  99.74 
 
 		 390 aa  790    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  84.58 
 
 		 390 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  63.97 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  63.98 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  47.67 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  47.81 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  47.81 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  48.1 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  44.68 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  44.66 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  43.3 
 
 		 392 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  43.31 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  43.59 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  45.03 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  45.48 
 
 		 392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  43.98 
 
 		 392 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  43.72 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  44.93 
 
 		 392 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  43.52 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  41.92 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  42.67 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  42.62 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  38.15 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  32.86 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 		 395 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  29.28 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 392 aa  126  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  30.15 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.5 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  29.65 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  26.22 
 
 		 463 aa  93.6  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.25 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  25.13 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 376 aa  89.4  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  27.5 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1846  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.83 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  21.99 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>