More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0628 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  98.73 
 
 
316 aa  648  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
319 aa  662  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  57.58 
 
 
188 aa  198  8e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
303 aa  128  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
305 aa  110  4e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
305 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
249 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  42.45 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 
291 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  43.14 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  25.7 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.61 
 
 
291 aa  82.8  8e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 
290 aa  82  1e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
306 aa  82  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 
322 aa  81.3  2e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 
312 aa  80.5  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
291 aa  80.9  3e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
291 aa  80.5  4e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 
291 aa  79.3  7e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
299 aa  79  9e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
293 aa  79.3  9e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
305 aa  78.6  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
305 aa  78.6  1e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 
304 aa  78.6  1e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
303 aa  78.6  1e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.49 
 
 
331 aa  77.8  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 
263 aa  77.8  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  28.03 
 
 
324 aa  78.2  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 
295 aa  77.4  3e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
319 aa  76.6  4e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 
305 aa  77  4e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 
288 aa  77  4e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 
291 aa  76.6  5e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
304 aa  76.3  6e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
278 aa  76.3  6e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.75993e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  24.79 
 
 
296 aa  76.3  7e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  1.05754e-05 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 
296 aa  75.9  8e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 
302 aa  75.9  9e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 
301 aa  75.5  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 
289 aa  75.5  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
307 aa  75.5  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 
294 aa  75.1  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 
289 aa  74.3  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
289 aa  74.7  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 
274 aa  73.9  3e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
305 aa  73.9  3e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 
287 aa  73.6  4e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
251 aa  73.6  4e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  6.97123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
293 aa  73.2  6e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
282 aa  73.2  6e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 
309 aa  72.8  7e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  42.11 
 
 
304 aa  72.4  9e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 
256 aa  72.4  9e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
291 aa  72.4  9e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 
299 aa  72.4  9e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
188 aa  72  1e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 
287 aa  72  1e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 
293 aa  71.6  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 
240 aa  71.2  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
301 aa  71.2  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 
412 aa  71.6  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 
300 aa  71.6  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
243 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
243 aa  71.2  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 
408 aa  70.9  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  3.5636e-09 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 
322 aa  71.2  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  71.2  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 
408 aa  71.2  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
255 aa  71.2  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
255 aa  71.2  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 
300 aa  71.6  2e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  37.08 
 
 
308 aa  70.9  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 
259 aa  70.5  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 
306 aa  70.5  3e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 
294 aa  70.9  3e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 
308 aa  70.5  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
301 aa  70.5  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 
306 aa  70.9  3e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
301 aa  70.5  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 
281 aa  70.5  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
315 aa  70.1  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
315 aa  70.1  4e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.94258e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
315 aa  70.1  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
315 aa  70.1  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
202 aa  70.5  4e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 
282 aa  70.5  4e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
278 aa  70.5  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
301 aa  70.5  4e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
291 aa  70.1  5e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
223 aa  69.7  5e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 
332 aa  70.1  5e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
255 aa  69.7  6e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
257 aa  69.7  6e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 
180 aa  69.7  6e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
257 aa  69.7  7e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
287 aa  69.7  7e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 
306 aa  69.3  8e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>