More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0612 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  100 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  96.75 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  87.8 
 
 		 123 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  86.99 
 
 		 123 aa  225  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  87.8 
 
 		 123 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  89.43 
 
 		 123 aa  225  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  86.99 
 
 		 123 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  76.23 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  75.41 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  75.41 
 
 		 126 aa  204  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  75.41 
 
 		 126 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  73.77 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  78.33 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  76.03 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  75 
 
 		 123 aa  199  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  76.03 
 
 		 121 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  75 
 
 		 144 aa  197  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  74.38 
 
 		 121 aa  194  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  73.55 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  74.38 
 
 		 121 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  73.55 
 
 		 121 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  75.83 
 
 		 121 aa  188  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 126 aa  184  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 133 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  45 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.53 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 		 1274 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  44.44 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 1352 aa  103  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1977 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1271 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  36.21 
 
 		 497 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1070 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1044 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  36.44 
 
 		 742 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 397 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1007 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 956 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1771 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 902 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.68 
 
 		 923 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.83 
 
 		 930 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.83 
 
 		 921 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.83 
 
 		 942 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.9 
 
 		 1233 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 929 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 869 aa  90.9  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1160 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1215  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.71 
 
 		 763 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1788 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 234 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1245 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  37.07 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1397 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  37.29 
 
 		 248 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1096 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.66 
 
 		 1765 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1078 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1172 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 778 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1230 aa  87.4  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1236 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  34.71 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1234 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>