More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0516 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  100 
 
 
419 aa  862  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  77.8 
 
 
419 aa  681  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  82.82 
 
 
419 aa  728  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  99.28 
 
 
419 aa  857  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  93.79 
 
 
419 aa  821  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  4.21461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  76.31 
 
 
419 aa  643  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  77.29 
 
 
422 aa  677  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  79.8 
 
 
419 aa  664  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  71.46 
 
 
417 aa  630  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  69.02 
 
 
418 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  63.77 
 
 
427 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  60.51 
 
 
429 aa  507  1e-142  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  57.93 
 
 
422 aa  493  1e-138  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  1.00934e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  50.86 
 
 
458 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
427 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.64 
 
 
441 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
444 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.85 
 
 
434 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
412 aa  85.1  2e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 
468 aa  80.9  4e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
425 aa  80.1  7e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
422 aa  77.8  3e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 
429 aa  77.8  4e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
431 aa  77.4  5e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
428 aa  76.3  9e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 
434 aa  75.9  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
408 aa  73.9  5e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3675  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
447 aa  73.9  5e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
428 aa  73.6  6e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
434 aa  72.8  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
414 aa  72.8  1e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
429 aa  72.8  1e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.86 
 
 
410 aa  72.4  2e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
408 aa  71.6  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 
424 aa  71.6  2e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.28 
 
 
419 aa  71.6  3e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
441 aa  71.6  3e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.53 
 
 
458 aa  70.5  5e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.79 
 
 
380 aa  68.9  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
435 aa  69.3  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
463 aa  69.3  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
424 aa  68.9  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
463 aa  69.3  1e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
451 aa  68.6  2e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.53575e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
424 aa  68.6  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
431 aa  67.4  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
424 aa  67.4  5e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
419 aa  67.4  5e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.89 
 
 
426 aa  66.6  7e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
419 aa  67  7e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.76 
 
 
412 aa  65.9  1e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 
428 aa  66.2  1e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
420 aa  65.9  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
420 aa  65.9  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
414 aa  66.2  1e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
419 aa  65.1  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.89 
 
 
427 aa  64.3  3e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
424 aa  64.3  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
495 aa  64.3  4e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
417 aa  64.3  4e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
440 aa  64.3  4e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
452 aa  64.3  4e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
441 aa  63.9  5e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  24.03 
 
 
424 aa  63.9  5e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
424 aa  63.9  5e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
420 aa  63.2  8e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
433 aa  62.4  1e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
454 aa  62.8  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
419 aa  62.4  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
470 aa  62.8  1e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.31 
 
 
450 aa  62.8  1e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.18 
 
 
439 aa  62.4  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
429 aa  62.4  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 
456 aa  61.6  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
422 aa  61.2  3e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
427 aa  61.2  4e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
427 aa  60.5  6e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
456 aa  60.1  7e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
441 aa  59.3  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.26 
 
 
449 aa  58.5  2e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 
421 aa  58.9  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3559  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
421 aa  58.5  2e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.725882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
436 aa  58.9  2e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
452 aa  58.2  2e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
449 aa  58.5  2e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
431 aa  57.8  3e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  2.38529e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.51 
 
 
408 aa  57.4  4e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 
408 aa  57.8  4e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
434 aa  57.4  5e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
415 aa  57.4  5e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
445 aa  57  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 
443 aa  56.6  8e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.87 
 
 
434 aa  55.8  1e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
413 aa  55.8  1e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
435 aa  56.2  1e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  28.3 
 
 
410 aa  56.2  1e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
462 aa  55.8  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.66828e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>