81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0499 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  900    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  65.99 
 
 
445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  44.04 
 
 
466 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  41.23 
 
 
469 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  40.68 
 
 
469 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  41.53 
 
 
455 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  40.45 
 
 
444 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  39.22 
 
 
474 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  37.25 
 
 
465 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 
455 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  41.83 
 
 
462 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.42 
 
 
453 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  39.64 
 
 
460 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.74 
 
 
475 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.13 
 
 
460 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.13 
 
 
460 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  39.91 
 
 
473 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  37.58 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  34.51 
 
 
474 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  34.27 
 
 
470 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  34.79 
 
 
471 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  33.99 
 
 
470 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  33.77 
 
 
466 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  33.77 
 
 
466 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  33.77 
 
 
466 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  33.77 
 
 
466 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  33.77 
 
 
466 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  33.77 
 
 
466 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 
445 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.95 
 
 
443 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.67 
 
 
468 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  34.56 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
455 aa  209  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  32.23 
 
 
453 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  31.81 
 
 
467 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  32.82 
 
 
456 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
485 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  32.49 
 
 
471 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  32.24 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
883 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.81 
 
 
482 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.53 
 
 
481 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  29.3 
 
 
479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  30.86 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  30.95 
 
 
478 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  34.69 
 
 
1751 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.07 
 
 
499 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
480 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
478 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
523 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  29.16 
 
 
468 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  29.16 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.65 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  24.54 
 
 
506 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  26.16 
 
 
458 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.36 
 
 
490 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  24.85 
 
 
633 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  27.57 
 
 
533 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  32.18 
 
 
125 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  18.56 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  18.56 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  46.38 
 
 
239 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.56 
 
 
507 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  18.94 
 
 
494 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  46.81 
 
 
61 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  25.23 
 
 
536 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  26.29 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  24.53 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  24.43 
 
 
578 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  24.77 
 
 
534 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  28.21 
 
 
483 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  26.11 
 
 
650 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  22.33 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  22.33 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  25.29 
 
 
582 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  29.46 
 
 
603 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  25.11 
 
 
572 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 
554 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>