More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0462 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 239 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.02 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.27 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.73 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.9 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.9 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.58 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  28.92 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  32.51 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  25.85 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  26.46 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.24 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  46.94 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  46.38 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 193 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  23.68 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.71 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>