87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0438 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  100 
 
 
433 aa  902    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  90.93 
 
 
420 aa  802    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  99.08 
 
 
433 aa  891    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  56.34 
 
 
413 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  56.1 
 
 
413 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  53.7 
 
 
431 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  54.43 
 
 
415 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  52.09 
 
 
411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  52.87 
 
 
412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  49.88 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  53.06 
 
 
407 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  49.14 
 
 
411 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  50.49 
 
 
413 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  53.06 
 
 
407 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  51.36 
 
 
407 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  51.59 
 
 
407 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  48.4 
 
 
411 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  52.32 
 
 
407 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  48.89 
 
 
411 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  49.38 
 
 
409 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  50.5 
 
 
420 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  49.38 
 
 
409 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  49.14 
 
 
408 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  49.13 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  46.91 
 
 
407 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  48.4 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  48.1 
 
 
400 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  45.68 
 
 
408 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  46.17 
 
 
409 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  44.94 
 
 
407 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  47.56 
 
 
410 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  43.45 
 
 
438 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  48.91 
 
 
373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  44.33 
 
 
413 aa  346  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  44.44 
 
 
402 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  42.2 
 
 
444 aa  333  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  43.1 
 
 
410 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  42.4 
 
 
415 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  42.22 
 
 
410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  41.21 
 
 
427 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  40.5 
 
 
409 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  41.77 
 
 
410 aa  308  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  37.44 
 
 
407 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  34.2 
 
 
418 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  36.03 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
421 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  35.38 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  35.59 
 
 
400 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  35.09 
 
 
400 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.24 
 
 
408 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.81 
 
 
405 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  33.25 
 
 
406 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  30.32 
 
 
409 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.99 
 
 
409 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  30.81 
 
 
412 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.55 
 
 
413 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  30.54 
 
 
412 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  28.29 
 
 
436 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.93 
 
 
416 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  28.06 
 
 
400 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  35.98 
 
 
178 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.65 
 
 
376 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.25 
 
 
391 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.1 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  25.46 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  22 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  23.43 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  22.85 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.62 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  25.33 
 
 
817 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  21.26 
 
 
396 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  21.59 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  26.38 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  20.35 
 
 
421 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  24.75 
 
 
352 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.64 
 
 
425 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.72 
 
 
414 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25.93 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.04 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  22.55 
 
 
391 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.13 
 
 
310 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  25 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.18 
 
 
305 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.48 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.83 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.15 
 
 
329 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
248 aa  43.1  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>