192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0423 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  100 
 
 
240 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  97.08 
 
 
240 aa  466  1e-130  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  65.23 
 
 
261 aa  317  9e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  38.59 
 
 
228 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  40.45 
 
 
258 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  39.45 
 
 
248 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  39.18 
 
 
229 aa  135  6e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  39.37 
 
 
232 aa  134  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  36.59 
 
 
230 aa  134  1e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  36.59 
 
 
230 aa  134  1e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  41.18 
 
 
250 aa  133  2e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  38.06 
 
 
207 aa  134  2e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  35.71 
 
 
237 aa  131  7e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  37.04 
 
 
234 aa  130  2e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  35.77 
 
 
225 aa  130  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  35.63 
 
 
236 aa  128  7e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  37.5 
 
 
229 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  40.27 
 
 
452 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  38.16 
 
 
206 aa  120  2e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  39.13 
 
 
207 aa  118  8e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  36.4 
 
 
453 aa  117  1e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  41.18 
 
 
447 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.28 
 
 
206 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  35.04 
 
 
255 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  42.93 
 
 
236 aa  116  4e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  34.57 
 
 
228 aa  116  4e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  35.39 
 
 
228 aa  116  4e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  34.27 
 
 
283 aa  114  2e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  38.76 
 
 
449 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  31.05 
 
 
244 aa  112  7e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  35.09 
 
 
279 aa  111  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  35.09 
 
 
207 aa  109  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  39.07 
 
 
449 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  35.36 
 
 
277 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.07 
 
 
254 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  31.27 
 
 
300 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  36.09 
 
 
255 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.36 
 
 
207 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  34.02 
 
 
283 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  35.37 
 
 
206 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  36.23 
 
 
207 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  34.98 
 
 
278 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  31.9 
 
 
274 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  42.05 
 
 
454 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  39.81 
 
 
219 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  35.77 
 
 
234 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  35.15 
 
 
276 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  32.4 
 
 
571 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  33.33 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  36.36 
 
 
598 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  32.27 
 
 
274 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  32.27 
 
 
274 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  32.42 
 
 
652 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  40.85 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  33.46 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  36 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  36.99 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  39.64 
 
 
274 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  34.02 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.36 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  34.82 
 
 
692 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  37.95 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  33.47 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18187e-05 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  32.05 
 
 
583 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  1.22606e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  34.4 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.65 
 
 
710 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  36.32 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  30.34 
 
 
570 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  33.61 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  29.37 
 
 
284 aa  91.7  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.66 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  27.34 
 
 
570 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  31.75 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  33.55 
 
 
288 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  33.89 
 
 
997 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  31.27 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  31.47 
 
 
724 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.46 
 
 
566 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.78 
 
 
661 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  32.95 
 
 
288 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  32.03 
 
 
288 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  36.11 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  31.96 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  33.49 
 
 
662 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  32.03 
 
 
287 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  32.54 
 
 
689 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  35.05 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  31.97 
 
 
680 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  32.5 
 
 
212 aa  84.7  1e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  30.92 
 
 
211 aa  83.6  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  1.66827e-05 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  31.33 
 
 
211 aa  84  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  4.0892e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  29.79 
 
 
302 aa  83.6  3e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  32.89 
 
 
674 aa  82.8  4e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  28.87 
 
 
285 aa  82.4  5e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  28.87 
 
 
285 aa  82.4  5e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.39 
 
 
236 aa  82.4  6e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  31.97 
 
 
201 aa  82.4  6e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  35.8 
 
 
246 aa  82  8e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  31.35 
 
 
230 aa  81.3  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  33.21 
 
 
299 aa  81.3  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.332912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>