21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0375 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0375  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  710    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4502  hypothetical protein  88.92 
 
 
334 aa  620  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2822  hypothetical protein  81.18 
 
 
341 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1479  hypothetical protein  66.96 
 
 
340 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206358  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1471  hypothetical protein  64.26 
 
 
340 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2938  hypothetical protein  64.6 
 
 
347 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3703  hypothetical protein  62.92 
 
 
351 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4786  hypothetical protein  38.17 
 
 
335 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000305274  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1310  hypothetical protein  30.28 
 
 
359 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0406  hypothetical protein  27.11 
 
 
334 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.953246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2837  hypothetical protein  27.27 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0779  hypothetical protein  28.2 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3551  hypothetical protein  28.15 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2707  hypothetical protein  28.38 
 
 
362 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000134366  hitchhiker  0.00145883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4098  hypothetical protein  27.87 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000500149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1116  hypothetical protein  25.74 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1476  hypothetical protein  25.94 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00768599  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1047  hypothetical protein  27.24 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4317  hypothetical protein  27.21 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00276005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1406  hypothetical protein  26.52 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4405  hypothetical protein  27.84 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996457  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>