More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0362 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 402 aa  830    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  83.17 
 
 		 398 aa  703    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  82.49 
 
 		 399 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  84.26 
 
 		 395 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  87.31 
 
 		 402 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  90.52 
 
 		 400 aa  758    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  89.28 
 
 		 400 aa  747    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  85.53 
 
 		 395 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  54.43 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  54.43 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  54.43 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  55.33 
 
 		 418 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  56.71 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  55.19 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  56.2 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  57.61 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  55.95 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  55.08 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  55.33 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  50.84 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  55.41 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  51.34 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  50.12 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  49.64 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  53.42 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  44.84 
 
 		 466 aa  347  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  43.3 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  51.1 
 
 		 272 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  39.29 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  38.12 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  39.54 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  37.47 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  37.47 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  37.22 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0554  CP4-like integrase  49.25 
 
 		 274 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  37.72 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  38.89 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  35.61 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  37.41 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  37.44 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  37.09 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  37.68 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  34.25 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.91 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  34.94 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.66 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  34.25 
 
 		 417 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.68 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  34.5 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  34.09 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35.07 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.54 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  35.43 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  35.09 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  36.16 
 
 		 397 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  33 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.83 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  34.07 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  35.09 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.67 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  35.09 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  35.09 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  34.43 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  36.76 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.58 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  34.16 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  34.16 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.17 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  32.51 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  34.43 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  32.91 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.25 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  34.51 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  33.08 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.18 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  34.01 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  32.66 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  35.66 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  33.17 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  35.09 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  35.75 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  33.33 
 
 		 391 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  31.9 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  32.91 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  33.5 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  33.17 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  32.43 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  31.73 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  31.95 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.66 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  31.98 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  32.59 
 
 		 419 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  31.82 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.5 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.08 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  33.01 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  32.92 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  31.34 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>