97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0353 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  100 
 
 		 357 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  98.32 
 
 		 369 aa  710    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  55.4 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  52.5 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  50.73 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  44.76 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  42.45 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  43.42 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  43.58 
 
 		 272 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  39.79 
 
 		 269 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  36.86 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 728 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  45.41 
 
 		 675 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 726 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  45.05 
 
 		 675 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  35.97 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 721 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  41.43 
 
 		 694 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  44.4 
 
 		 698 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.08 
 
 		 699 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  38.18 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.14 
 
 		 689 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  44.14 
 
 		 773 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  44.84 
 
 		 708 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 712 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  39.34 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  40.64 
 
 		 721 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  37.73 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  43.69 
 
 		 691 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  37.73 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  37.73 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  37.25 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  36.8 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  38.49 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  40.8 
 
 		 308 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  35.66 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  43.11 
 
 		 669 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  34.28 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  32.24 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  38.63 
 
 		 293 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  33.1 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  32.75 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 351 aa  156  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  32.75 
 
 		 355 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  38.08 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  32.4 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  37.07 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  33.45 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  33.1 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  34.47 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  33.8 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  32.19 
 
 		 346 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  29.34 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  32.07 
 
 		 315 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  31.41 
 
 		 350 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  37.72 
 
 		 181 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  33.2 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  32.77 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  32.35 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  49.59 
 
 		 125 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 139 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  30.43 
 
 		 671 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  42.22 
 
 		 130 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  52.11 
 
 		 79 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  32 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  34.57 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  28.67 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  28.82 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  29.79 
 
 		 145 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  32.41 
 
 		 256 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  26.98 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.14 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.14 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  24.11 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  27.08 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  35.48 
 
 		 647 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.14 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  28.38 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  28.41 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2855  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.84 
 
 		 466 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.15 
 
 		 632 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  25.17 
 
 		 272 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  28.83 
 
 		 778 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>