More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0168 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  100 
 
 
274 aa  539  1e-152  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  100 
 
 
274 aa  539  1e-152  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  74.14 
 
 
266 aa  335  4e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  57.09 
 
 
276 aa  251  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  48.66 
 
 
270 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  49.81 
 
 
268 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  9.04095e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  48.67 
 
 
275 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  46.09 
 
 
291 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  57.55 
 
 
268 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  46.36 
 
 
274 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  45.28 
 
 
269 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  46.09 
 
 
291 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  45.59 
 
 
270 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  46.13 
 
 
279 aa  196  4e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  46.64 
 
 
278 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  47.06 
 
 
267 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  47.06 
 
 
267 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  42.58 
 
 
277 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  50.39 
 
 
295 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  47.1 
 
 
297 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  46.98 
 
 
290 aa  184  1e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  45.59 
 
 
270 aa  183  2e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  42.15 
 
 
282 aa  184  2e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  45.8 
 
 
274 aa  183  2e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  46.74 
 
 
273 aa  182  4e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  40.96 
 
 
271 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  40.3 
 
 
274 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  46.1 
 
 
289 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  46.15 
 
 
279 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  46.04 
 
 
289 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  46.35 
 
 
289 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  39.24 
 
 
293 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  40.3 
 
 
276 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  43.23 
 
 
274 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  44.91 
 
 
290 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  44.44 
 
 
275 aa  164  1e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  46.07 
 
 
283 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  43.7 
 
 
275 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  43.38 
 
 
272 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  43.25 
 
 
289 aa  155  5e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  43.8 
 
 
275 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  41.26 
 
 
271 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  37.74 
 
 
294 aa  151  9e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  36.98 
 
 
294 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  33.82 
 
 
293 aa  146  4e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  41.44 
 
 
279 aa  146  4e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  39.13 
 
 
287 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  42.54 
 
 
307 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  37.26 
 
 
275 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  38.29 
 
 
321 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  40.94 
 
 
278 aa  137  3e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  38.96 
 
 
306 aa  134  1e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  36.53 
 
 
271 aa  134  2e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  35.71 
 
 
282 aa  134  2e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  40.6 
 
 
310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  40.6 
 
 
310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  40.6 
 
 
310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.27 
 
 
294 aa  132  7e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  38.14 
 
 
307 aa  132  8e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  37.02 
 
 
282 aa  132  8e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  36.8 
 
 
289 aa  130  2e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  36.94 
 
 
267 aa  130  2e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.46 
 
 
293 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.54 
 
 
292 aa  129  4e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.54 
 
 
292 aa  129  4e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.01 
 
 
276 aa  129  5e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  38.31 
 
 
306 aa  129  5e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  38.43 
 
 
286 aa  127  2e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  38.31 
 
 
280 aa  126  4e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  36.86 
 
 
280 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.86 
 
 
280 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  37.99 
 
 
295 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  38.49 
 
 
281 aa  125  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.86 
 
 
280 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  36.76 
 
 
277 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  33.1 
 
 
306 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  38.02 
 
 
283 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  42.21 
 
 
273 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.54 
 
 
289 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  42.8 
 
 
276 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  38.52 
 
 
277 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  37.22 
 
 
291 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  34.78 
 
 
282 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  37.78 
 
 
281 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  35.32 
 
 
287 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  36.46 
 
 
291 aa  121  1e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  37.5 
 
 
311 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  32.98 
 
 
304 aa  119  4e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.32 
 
 
284 aa  119  4e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  37.04 
 
 
274 aa  119  4e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.62 
 
 
275 aa  119  5e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  43.31 
 
 
189 aa  119  5e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 
272 aa  119  5e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 
272 aa  119  5e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  34.98 
 
 
303 aa  119  5e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 
272 aa  119  5e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.59 
 
 
292 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.65 
 
 
296 aa  117  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2925  HpcH/HpaI aldolase  40.64 
 
 
310 aa  116  4e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.253914  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.82 
 
 
288 aa  116  4e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>