30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0072 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1040    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  64.02 
 
 		 528 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  99.6 
 
 		 502 aa  1016    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  45.01 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  40.67 
 
 		 467 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  31.74 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  31.73 
 
 		 513 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  35.34 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  30.16 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  28.11 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  28.21 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  27.91 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  27.68 
 
 		 647 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  27.32 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  28.64 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  27.68 
 
 		 646 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  26.4 
 
 		 563 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  26.48 
 
 		 552 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  26.05 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  24.87 
 
 		 617 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  26.62 
 
 		 571 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  25.74 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  24.36 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  24.88 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  26.18 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  24.57 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  24.75 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  26.11 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  22.66 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>