89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2102 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  45.01 
 
 		 1064 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  44.36 
 
 		 1062 aa  785    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  100 
 
 		 1052 aa  2085    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  56.26 
 
 		 1042 aa  1031    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  86.94 
 
 		 1052 aa  1794    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  50.33 
 
 		 1047 aa  988    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  45.24 
 
 		 1059 aa  845    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  45.1 
 
 		 1064 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  99.81 
 
 		 1052 aa  2081    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1049 aa  596  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  39.83 
 
 		 1001 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  39.89 
 
 		 1048 aa  591  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  39.36 
 
 		 1049 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  39.67 
 
 		 1047 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  39.61 
 
 		 1047 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  39.89 
 
 		 1043 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  40.19 
 
 		 1045 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  39.14 
 
 		 1053 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  39.55 
 
 		 1042 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  41.83 
 
 		 1015 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  39.85 
 
 		 1048 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  39.27 
 
 		 1049 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  39.69 
 
 		 1040 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  39.96 
 
 		 1037 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  37.94 
 
 		 1054 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.69 
 
 		 1018 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  35.61 
 
 		 1076 aa  495  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  37.51 
 
 		 999 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.08 
 
 		 977 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1016 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  36.25 
 
 		 991 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  34.44 
 
 		 1000 aa  393  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  33.11 
 
 		 997 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  32.95 
 
 		 997 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  35.29 
 
 		 1014 aa  379  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.51 
 
 		 986 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  31.24 
 
 		 988 aa  354  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  33.27 
 
 		 991 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  30.63 
 
 		 993 aa  336  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  31.77 
 
 		 980 aa  331  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  33.84 
 
 		 959 aa  301  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.76 
 
 		 914 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  21 
 
 		 911 aa  170  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.62 
 
 		 962 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  23.23 
 
 		 890 aa  85.5  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  24.71 
 
 		 947 aa  81.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.4 
 
 		 779 aa  76.6  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.74 
 
 		 976 aa  75.5  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.12 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.63 
 
 		 957 aa  73.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  23.92 
 
 		 951 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  34.65 
 
 		 864 aa  68.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  23 
 
 		 991 aa  68.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.04 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.67 
 
 		 958 aa  68.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  43.96 
 
 		 142 aa  65.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 846 aa  64.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.89 
 
 		 994 aa  63.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.55 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.39 
 
 		 788 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.39 
 
 		 788 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.1 
 
 		 788 aa  56.2  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25 
 
 		 957 aa  56.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  24.14 
 
 		 855 aa  54.7  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  20.83 
 
 		 781 aa  54.3  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 1059 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  25.62 
 
 		 930 aa  52.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.65 
 
 		 1048 aa  51.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.3 
 
 		 856 aa  50.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.91 
 
 		 919 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  20.58 
 
 		 911 aa  48.9  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.87 
 
 		 990 aa  48.9  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  29.85 
 
 		 351 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  30.15 
 
 		 280 aa  47.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  29.95 
 
 		 302 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  31.13 
 
 		 323 aa  47.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  26.01 
 
 		 913 aa  47.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.22 
 
 		 989 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.45 
 
 		 906 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  34.55 
 
 		 912 aa  47  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.25 
 
 		 984 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.43 
 
 		 1051 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  30.8 
 
 		 856 aa  45.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  31.56 
 
 		 856 aa  45.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.23 
 
 		 935 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  23.04 
 
 		 908 aa  45.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 1144 aa  45.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.65 
 
 		 1049 aa  44.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  29.76 
 
 		 286 aa  44.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>